试图将.tsv转换为.csv.这个:
import csv
# read tab-delimited file
with open('DataS1_interactome.tsv','rb') as fin:
cr = csv.reader(fin, delimiter='\t')
filecontents = [line for line in cr]
# write comma-delimited file (comma is the default delimiter)
with open('interactome.csv','wb') as fou:
cw = csv.writer(fou, quotechar='', quoting=csv.QUOTE_NONE)
cw.writerows(filecontents)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
给我这个错误:
File "tsv2csv.py", line 11, in <module>
cw.writerows(filecontents)
_csv.Error: need to escape, but no escapechar set
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
在尝试写入 CSV 文件时,它遇到一个必须插入转义字符的标记。但是,您还没有定义一个。
方言转义符
如果quoting 设置为QUOTE_NONE 和quotechar 如果doublequote 为False,则作者用于转义分隔符的单字符字符串。在阅读时,转义字符会从以下字符中删除任何特殊含义。它默认为 None,禁用转义。
来源:https : //docs.python.org/2/library/csv.html#csv.Dialect.escapechar
示例代码:
# write comma-delimited file (comma is the default delimiter)
with open('interactome.csv','wb') as fou:
cw = csv.writer(fou, quotechar='', quoting=csv.QUOTE_NONE, escapechar='\\')
cw.writerows(filecontents)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
import pandas as pd
tsv_file='name.tsv'
csv_table=pd.read_table(tsv_file,sep='\t')
csv_table.to_csv('new_name.csv',index=False)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
我们可以使用上面的代码将.tsv文件转换为.csv文件
| 归档时间: |
|
| 查看次数: |
13319 次 |
| 最近记录: |