R中对dist函数有稀疏支持吗？

Question

有没有人听说任何dist{stats}与R创建的功能相同的包或功能

距离矩阵,通过使用指定的距离度量来计算数据矩阵的行之间的距离,

但是将一个sprase矩阵作为输入？

我的data.frame(已命名dataCluster)有dims:7000 X 10000,几乎99%稀疏.在不稀疏的常规形式中,此功能似乎不会停止工作......

h1 <- hclust( dist( dataCluster ) , method = "complete" )

类似的问题没有答案: 稀疏矩阵作为R中的分层聚类的输入

Answer 1

你要wordspace::dist.matrix。

它接受来自稀疏矩阵Matrix包（其是不明确从文档），并且还可以做跨距离，同时输出Matrix与dist对象和更。

'cosine'不过，默认的距离度量是，因此请务必指定method = 'euclidean'是否要。