che*_*gvt 15 r contour ggplot2
我正在寻找完全填充ggplot2的stat_contour生成的轮廓的方法.目前的结果是这样的:
# Generate data
library(ggplot2)
library(reshape2) # for melt
volcano3d <- melt(volcano)
names(volcano3d) <- c("x", "y", "z")
v <- ggplot(volcano3d, aes(x, y, z = z))
v + stat_contour(geom="polygon", aes(fill=..level..))
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可以通过如下手动修改代码来产生期望的结果.
v + stat_contour(geom="polygon", aes(fill=..level..)) +
theme(panel.grid=element_blank())+ # delete grid lines
scale_x_continuous(limits=c(min(volcano3d$x),max(volcano3d$x)), expand=c(0,0))+ # set x limits
scale_y_continuous(limits=c(min(volcano3d$y),max(volcano3d$y)), expand=c(0,0))+ # set y limits
theme(panel.background=element_rect(fill="#132B43")) # color background
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
我的问题:有没有办法完全填充绘图而无需手动指定颜色或使用geom_tile()
?
che*_*gvt 10
作为@tonytonov曾建议该线程,透明区域可以通过关闭多边形被删除.
# check x and y grid
minValue<-sapply(volcano3d,min)
maxValue<-sapply(volcano3d,max)
arbitaryValue=min(volcano3d$z-10)
test1<-data.frame(x=minValue[1]-1,y=minValue[2]:maxValue[2],z=arbitaryValue)
test2<-data.frame(x=minValue[1]:maxValue[1],y=minValue[2]-1,z=arbitaryValue)
test3<-data.frame(x=maxValue[1]+1,y=minValue[2]:maxValue[2],z=arbitaryValue)
test4<-data.frame(x=minValue[1]:maxValue[1],y=maxValue[2]+1,z=arbitaryValue)
test<-rbind(test1,test2,test3,test4)
vol<-rbind(volcano3d,test)
w <- ggplot(vol, aes(x, y, z = z))
w + stat_contour(geom="polygon", aes(fill=..level..)) # better
# Doesn't work when trying to get rid of unwanted space
w + stat_contour(geom="polygon", aes(fill=..level..))+
scale_x_continuous(limits=c(min(volcano3d$x),max(volcano3d$x)), expand=c(0,0))+ # set x limits
scale_y_continuous(limits=c(min(volcano3d$y),max(volcano3d$y)), expand=c(0,0)) # set y limits
# work here!
w + stat_contour(geom="polygon", aes(fill=..level..))+
coord_cartesian(xlim=c(min(volcano3d$x),max(volcano3d$x)),
ylim=c(min(volcano3d$y),max(volcano3d$y)))
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这个调整仍然存在的问题是找到除了试验和错误之外的方法来确定arbitaryValue
.
[从这里编辑]
只是一个快速更新,以显示我如何确定,arbitaryValue
而不必猜测每个数据集.
BINS<-50
BINWIDTH<-(diff(range(volcano3d$z))/BINS) # reference from ggplot2 code
arbitaryValue=min(volcano3d$z)-BINWIDTH*1.5
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这似乎适用于我正在处理的数据集.不确定是否适用于其他人.另外,还要注意的是,我设置分档值这里需要我将不得不使用bins=BINS
在stat_contour
.
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