两个字符串之间的总不匹配

0 python genetics biopython

我正在寻找一种方法来查找 python 中两个字符串之间不匹配的总数。我的输入是一个看起来像这样的列表

['sequence=AGATGG', 'sequence=AGCTAG', 'sequence=TGCTAG',
 'sequence=AGGTAG', 'sequence=AGCTAG', 'sequence=AGAGAG']
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对于每个字符串,我想看看它与序列有多少差异"sequence=AGATAA"。因此,如果输入[0]来自上面的列表,则输出将如下所示:

sequence=AGATGG, 2
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我不知道是否将每个字母拆分为单独的列表,或者是否应该尝试以某种方式比较整个字符串。任何帮助都是有用的,谢谢

ch3*_*3ka 5

您可以使用sum和轻松计算两个字符串之间成对不匹配的总数zip

>>> s1='AGATGG'
>>> s2='AGATAA'
>>> sum(c1!=c2 for c1,c2 in zip(s1,s2))
2
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如果您必须处理大小不同的字符串,您可能希望使用from itertools import zip_longest而不是zip