考虑随机/混合效应后的共线性

Question

在考虑随机效应后,两个/更多的预测变量会变得更多/更少共线吗？

在我的情况下,我在建模之前测试了共线性,例如使用VIF,一切都检查出来.然而,不同模型的排名(使用IC)使我不确定它是否真的能够在预测变量之间分离.

有任何想法吗？

PS!那些代表比我更高的人可以添加一个更相关的标签,如共线性吗？

Answer 1

此博客文章中列出了一些解决方案.他们使用一些代码来创建一个函数,分别为和R软件包计算VIF lmer和lme模型对象.我已复制下面函数的代码.lmernlme

vif.lme <- function (fit) {
    ## adapted from rms::vif
    v <- vcov(fit)
    nam <- names(fixef(fit))
    ## exclude intercepts
    ns <- sum(1 * (nam == "Intercept" | nam == "(Intercept)"))
    if (ns > 0) {
        v <- v[-(1:ns), -(1:ns), drop = FALSE]
        nam <- nam[-(1:ns)] }
    d <- diag(v)^0.5
    v <- diag(solve(v/(d %o% d)))
    names(v) <- nam
    v }

一旦运行该代码一次,您就可以vif.lme在R环境中执行新功能.我在下面使用随机数据集和一个无信息的随机效应给出一个例子.我使用无信息的随机效应,以便lme内部的结果nlme将为lm基线R 生成与预测器相同的参数值.然后,我使用上面的代码计算方差膨胀因子,以及用于计算VIF vif的car包中的functino 对于线性模型,表明它们给出相同的输出.

#make 4 vectors- c is used as an uninformative random effect for the lme model
a<-c(1:10)
b1<-c(2,4,6,8,10,100,14,16,18,20)
b2<-c(1,9,2,4,5,6,4,3,2,-1)
c<-c(1,1,1,1,1,1,1,1,1,1)
test<-data.frame(a,b1,b2,c)

#model a as a function of b1 and b2, and c as a random effect
require(nlme)
fit<-lme(a~b1+b2, random=~1|c,data=test)
#see how the model fits
summary(fit)
#check variance inflation factors
vif.lme(fit)

#create a new regular linear regression model and check VIF using the car package.
#answers should be the same, as our random effect above was totally uninformative
require(car)
fit2<- lm(a~b1+b2,data=test)
#check to see that parameter fits are the same.
summary(fit2)
#check to see that variance inflation factors are the same
vif(fit2)