OpenGL说"from_param接收到一个非连续的数组"

Question

安装Yosemite后,我不得不升级numpy,PyOpenGL等.

现在,一个以前工作的程序给了我以下堆栈跟踪:

file "latebind.pyx", line 44, in OpenGL_accelerate.latebind.Curry.__call__ (src/latebind.c:1201)
  File "/opt/local/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.4/lib/python3.4/site-packages/OpenGL/GL/VERSION/GL_1_5.py", line 89, in glBufferData
    return baseOperation( target, size, data, usage )
  File "latebind.pyx", line 32, in OpenGL_accelerate.latebind.LateBind.__call__ (src/latebind.c:989)
  File "wrapper.pyx", line 314, in OpenGL_accelerate.wrapper.Wrapper.__call__ (src/wrapper.c:6505)
  File "wrapper.pyx", line 311, in OpenGL_accelerate.wrapper.Wrapper.__call__ (src/wrapper.c:6439)
ctypes.ArgumentError: ("argument 3: <class 'OpenGL.error.CopyError'>: from_param received a non-contiguous array! []", (GL_ARRAY_BUFFER, 0, array([],
      dtype=[('time', '<f8'), ('data', [('cluster_index', '<i4'), ('delta_diag_out', '<f8')])]), GL_STREAM_DRAW))

看起来PyOpenGL希望我的数组是连续的.在PyOpenGL中查看numpy_formathandler.pyx中的源代码:

if not PyArray_ISCARRAY( instance ):
            raise CopyError(
                """from_param received a non-contiguous array! %s"""%(
                    working,
                )
            )

并且PyArray_ISCARRAY(arr)"如果arr的数据区域是C风格连续的,并且PyArray_ISBEHAVED(arr)为真,则求值为true." 因此,"PyArray_ISBEHAVED(arr)如果arr的数据区域是对齐且可写的,则根据其描述符以机器字节顺序进行评估."

但是,flags推送到OpenGL的数组的属性是:

  C_CONTIGUOUS : True
  F_CONTIGUOUS : True
  OWNDATA : False
  WRITEABLE : True
  ALIGNED : False
  UPDATEIFCOPY : False

也许我需要对齐阵列？但使用numpy.require与requirements={'ALIGNED': True}似乎不起作用.

我看了numpy 1.9中的变化,这表明:

有一个新的编译时环境变量NPY_RELAXED_STRIDES_CHECKING.如果此变量设置为1,则numpy将考虑更多数组为C或F连续 - 例如,可以使列向量同时被视为C连续和F连续.新定义更准确,允许更快的代码,减少不必要的副本,并在内部简化numpy的代码.但是,它也可能会破坏第三方库,这些库对C和F连续数组的步幅值做出过于强烈的假设.(目前还知道这会使用内存视图中断Cython代码,这将在Cython中修复.)这将成为未来发布的默认值,因此请检查您的代码以防止在以下情况下执行:

NPY_RELAXED_STRIDES_CHECKING = 1个python setup.py安装

您可以通过运行来检查NPY_RELAXED_STRIDES_CHECKING是否生效:

np.ones((10,1),order ="C").flags.f_contiguous

如果启用了轻松的步幅检查,则为True,否则为False.到目前为止我们看到的典型问题是C代码与C连续数组一起工作,并假设可以通过查看PyArray_STRIDES(arr)数组中的最后一个元素来访问itemsize.当轻松的步幅生效时,这是不正确的(实际上,在某些角落情况下它从来都不是这样).相反,使用PyArray_ITEMSIZE(arr).

但是,np.ones((10, 1), order="C").flags.f_contiguous我的系统是假的.所以我很难过.改变了什么导致opengl认为我发送的数组不是连续的和对齐的？有没有办法用力对齐阵列？

Answer 1

这可能与 numpy 1.9 中的这个错误有关，没有人分配给这个错误： https: //github.com/numpy/numpy/issues/5224