R：根据行名和列名添加矩阵

Question

我有两个矩阵要根据行名和列名求和。矩阵不一定具有共同的所有行和列 - 任一矩阵中可能缺少某些行和列。

例如，考虑两个矩阵 A 和 B：

A=                 B=
  a b c d            a c d e
v 1 1 1 0          v 0 0 0 1
w 1 1 0 1          w 0 0 1 0
x 1 0 1 1          y 0 1 0 0
y 0 1 1 1          z 1 0 0 0

矩阵 A 中缺少 e 列，矩阵 B 中缺少 b 列。 矩阵 A 中缺少行 z，矩阵 B 中缺少行 x。

我正在寻找的汇总表是：

Sum=
  a b  c d e
v 1 1  1 0 1
w 1 1  0 2 0
x 1 0  1 1 na
y 0 1  2 1 0
z 1 na 0 0 0

最终矩阵中的行和列顺序无关紧要，只要矩阵是完整的，即包含所有数据。缺失值不必是“Na”，而可以是“0”。

我不确定是否有一种不涉及 for 循环的方法可以做到这一点。任何帮助将非常感激。

我的解决方案

通过将矩阵转换为数据帧，按行绑定数据帧，然后将结果数据帧转换回矩阵，我设法轻松地做到了这一点。这看起来有效，但也许有人可以仔细检查或让我知道是否有更好的方法。

library(reshape2)
A_df=as.data.frame(as.table(A))
B_df=as.data.frame(as.table(B))

merged_df=rbind(A_df,B_df)

Summed_matrix=acast(merged_df, Var1 ~ Var2, sum)

merge_df 看起来像这样：

   Var1 Var2 Freq
1     v    a    1
2     w    a    1
3     x    a    1
4     y    a    0
5     v    b    1
6     w    b    1
etc...

Answer 1

也许你可以尝试：

cAB <- union(colnames(A), colnames(B))
rAB <- union(rownames(A), rownames(B))

A1 <- matrix(0, ncol=length(cAB), nrow=length(rAB), dimnames=list(rAB, cAB))
B1 <- A1

indxA <- outer(rAB, cAB, FUN=paste) %in% outer(rownames(A), colnames(A), FUN=paste) 
indxB <- outer(rAB, cAB, FUN=paste) %in% outer(rownames(B), colnames(B), FUN=paste)
A1[indxA] <- A
B1[indxB] <- B

A1+B1 #because it was mentioned to have `0` as missing values
#  a b c d e
#v 1 1 1 0 1
#w 1 1 0 2 0
#x 1 0 1 1 0
#y 0 1 2 1 0
#z 1 0 0 0 0

如果你想得到NA缺失值

A1 <- matrix(NA, ncol=length(cAB), nrow=length(rAB), dimnames=list(rAB, cAB))
B1 <- A1

A1[indxA] <- A
B1[indxB] <- B

indxNA <- is.na(A1) & is.na(B1)
A1[is.na(A1)!= indxNA] <- 0
B1[is.na(B1)!= indxNA] <- 0


A1+B1
#  a  b c d  e
#v 1  1 1 0  1
#w 1  1 0 2  0
#x 1  0 1 1 NA
#y 0  1 2 1  0
#z 1 NA 0 0  0

或使用 reshape2

library(reshape2)
acast(rbind(melt(A), melt(B)), Var1~Var2, sum) #Inspired from the OP's idea
#  a b c d e
#v 1 1 1 0 1
#w 1 1 0 2 0
#x 1 0 1 1 0
#y 0 1 2 1 0
#z 1 0 0 0 0

数据

A <- structure(c(1L, 1L, 1L, 0L, 1L, 1L, 0L, 1L, 1L, 0L, 1L, 1L, 0L, 
1L, 1L, 1L), .Dim = c(4L, 4L), .Dimnames = list(c("v", "w", "x", 
"y"), c("a", "b", "c", "d")))

B <- structure(c(0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 1L, 
0L, 0L, 0L), .Dim = c(4L, 4L), .Dimnames = list(c("v", "w", "y", 
"z"), c("a", "c", "d", "e")))