多个RowSideColor列来自gplots包的heatmap.2

Question

我希望能够使用两个RowSideColor条与R包图中的heatmap.2函数,但我无法弄清楚如何做到这一点.我已经在堆栈溢出之前看到过这个问题,并且在回答问题的同时,回复没有解决这个问题.将因子添加到输入数据矩阵将不起作用,因为它会影响层次聚类的结果.如果有必要,我愿意使用其他类似热图的功能来实现我的目标.

谢谢,布拉德

Answer 1

我之前想要这样做,并且总是习惯于制作两个热图,并将一个RowSideColors条形图从一个热图复制粘贴到另一个热图上.我只是做了一些搜索,发现了heatmap.plus可以做到这一点的软件包:

# install.packages("heatmap.plus") #install package
require("heatmap.plus")

data(cars) # using cars data as example

# create a matrix of colors for RowSideColors
myCols = cbind(rep(c("yellow", "blue"), 25), rep(c("red", "green"), 25))

heatmap.plus(data.matrix(cars), RowSideColors=myCols)

RowSideColors此包中的参数可以接受颜色矩阵以绘制多个行侧颜色.