环境变量和RStudio

Question

我正在使用RStudio并且一直在尝试使用rPython包为我做一些电子邮件处理.这涉及解压缩一些电子邮件附件,因此我需要使用比2.7更新的Python版本.

我在ubuntu上,所以我在bash脚本中设置了环境变量,我可以看到它有效:

庆典

alias python=python3
export RPYTHON_PYTHON_VERSION=3

命令行

echo $RPYTHON_PYTHON_VERSION
3

然而,当我在RStudio中安装rPython时,它说:

将包安装到'/home/richardc/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1'(未指定'lib')尝试URL'http://cran.rstudio.com/src/contrib/rPython_0 . 0-5.tar.gz '内容类型'应用程序/ x-gzip'长度37109字节(36 Kb)

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• 安装源包'rPython'...**包'rPython'成功解压缩并且MD5总和检查 了一个特定的python版本使用没有提供 默认为系统中的标准python

因此,尽管python --version返回3.4并设置环境变量,它默认为2.7

我希望我有一些直截了当的东西.

Answer 1

@nickbloom竟是接近它,但它不是Sys.setenv(RPYTHON_PYTHON_PATH=3),但Sys.setenv(RPYTHON_PYTHON_VERSION=3)

在我的情况下(我有Python 3.5)它是:

> Sys.setenv(RPYTHON_PYTHON_VERSION=3.5)  
> install.packages('rPython')  
Installing package into ‘/usr/lib64/R/library’ (as ‘lib’ is unspecified) trying URL  
'http://r.meteo.uni.wroc.pl/src/contrib/rPython_0.0-5.tar.gz' Content  
type 'application/x-gzip' length 37109 bytes (36 KB)  
================================================== downloaded 36 KB  

* installing *source* package ‘rPython’ ...  
** package ‘rPython’ successfully unpacked and MD5 sums checked which: no python3.5-config in (/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin) could not  
locate python3.5-config  

正如你现在所看到的,它正在寻找python3.5-config,这是我上面指定的版本.

此外,如果你的python3.5-config文件不在PATH中,那么你可能还想设置PATH:

Sys.setenv(PATH='/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/usr/local/bin')

您可能还需要重命名python3.5m-config,因为rPython总是查找[pythoncommand] -config,在我的例子中是python3.5而不是python3.5m,所以我只是将python3.5m-config重命名为python3.5 -config然后安装了rPython包.