需要从ggplot geom_histogram中提取数据

Geo*_*rge 34 r histogram ggplot2

您好我使用数据框中的ggplot2 geom_histogram函数绘制了一个图,请参阅下面的示例并链接到ggplot直方图需要使用嵌套的ddply函数和facet wrap来标记每个geom_vline的因子

现在我需要创建一个包含上图中使用的汇总数据的数据框.有人可以帮忙吗?提前致谢.G

Sector2 Family  Year    Length
BUN Acroporidae 2010    332.1300496
BUN Poritidae   2011    141.1467966
BUN Acroporidae 2012    127.479
BUN Acroporidae 2013    142.5940556
MUR Faviidae    2010    304.0405
MUR Faviidae    2011    423.152
MUR Pocilloporidae  2012    576.0295
MUR Poritidae   2013    123.8936667
NTH Faviidae    2010    60.494
NTH Faviidae    2011    27.427
NTH Pocilloporidae  2012    270.475
NTH Poritidae   2013    363.4635
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Did*_*rts 57

要获得实际绘制的值,您可以使用函数ggplot_build(),其中参数是您的绘图.

p <- ggplot(mtcars,aes(mpg))+geom_histogram()+
      facet_wrap(~cyl)+geom_vline(data=data.frame(x=c(20,30)),aes(xintercept=x))

pg <- ggplot_build(p)
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这将使列表和一个子列表被命名data.此子列表包含带有在绘图中使用的值的数据框,例如,对于histrogramm,它包含y值(与之相同count).如果使用构面,则列PANEL显示使用哪个构面值.如果geom_你的图中有多个数据,那么数据将包含每个数据帧 - 在我的例子中,有一个用于histogramm的数据帧和另一个用于vlines的数据帧.

head(pg$data[[1]])
  y count         x ndensity ncount density PANEL group ymin ymax
1 0     0  9.791667        0      0       0     1     1    0    0
2 0     0 10.575000        0      0       0     1     1    0    0
3 0     0 11.358333        0      0       0     1     1    0    0
4 0     0 12.141667        0      0       0     1     1    0    0
5 0     0 12.925000        0      0       0     1     1    0    0
6 0     0 13.708333        0      0       0     1     1    0    0
      xmin     xmax
1  9.40000 10.18333
2 10.18333 10.96667
3 10.96667 11.75000
4 11.75000 12.53333
5 12.53333 13.31667
6 13.31667 14.10000

head(pg$data[[2]])
  xintercept PANEL group xend  x
1         20     1     1   20 20
2         30     1     1   30 30
3         20     2     2   20 20
4         30     2     2   30 30
5         20     3     3   20 20
6         30     3     3   30 30
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  • 只需执行类似`df < - pg $ data [[1]]`的操作,将其保存为名为`df`的数据帧 (3认同)
  • 因为我对此很陌生。我可以将此列表转换为 Dataframe 而不是 rstudio 中的值吗?我想我可以复制并粘贴它,但那是作弊。再次感谢D (2认同)

Moo*_*per 20

如果您只需要数据,它似乎layer_data正是为此精确设计的:

layer_data(p, 1)
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它将为您提供第一层的数据,与之相同ggplot_build(p)$data[[1]].

它的源代码确实很准确 function (plot, i = 1L) ggplot_build(plot)$data[[i]]

  • 根据上面的答案,如果您需要在绘图代码中间访问绘图的当前状态(例如,您没有保存添加摘要的“p”),您可以使用“last_plot()”访问绘图直到最近的“+” (3认同)
  • 这很金.值得更多的喜欢. (2认同)
  • 有没有办法获取标签而不是组号? (2认同)

jza*_*dra 7

虽然其他答案让您接近,但如果您正在寻找传递给 的实际数据ggplot(),您可以使用:

ggplot_build(p)$plot$data

require(tidyverse)

p <- ggplot(mtcars,aes(mpg))+geom_histogram()+
  facet_wrap(~cyl)+geom_vline(data=data.frame(x=c(20,30)),aes(xintercept=x))

pg <- ggplot_build(p)
#> `stat_bin()` using `bins = 30`. Pick better value with `binwidth`.

pg$plot$data
#>                      mpg cyl  disp  hp drat    wt  qsec vs am gear carb
#> Mazda RX4           21.0   6 160.0 110 3.90 2.620 16.46  0  1    4    4
#> Mazda RX4 Wag       21.0   6 160.0 110 3.90 2.875 17.02  0  1    4    4
#> Datsun 710          22.8   4 108.0  93 3.85 2.320 18.61  1  1    4    1
#> Hornet 4 Drive      21.4   6 258.0 110 3.08 3.215 19.44  1  0    3    1
#> Hornet Sportabout   18.7   8 360.0 175 3.15 3.440 17.02  0  0    3    2
#> Valiant             18.1   6 225.0 105 2.76 3.460 20.22  1  0    3    1
#> Duster 360          14.3   8 360.0 245 3.21 3.570 15.84  0  0    3    4
#> Merc 240D           24.4   4 146.7  62 3.69 3.190 20.00  1  0    4    2
#> Merc 230            22.8   4 140.8  95 3.92 3.150 22.90  1  0    4    2
#> Merc 280            19.2   6 167.6 123 3.92 3.440 18.30  1  0    4    4
#> Merc 280C           17.8   6 167.6 123 3.92 3.440 18.90  1  0    4    4
#> Merc 450SE          16.4   8 275.8 180 3.07 4.070 17.40  0  0    3    3
#> Merc 450SL          17.3   8 275.8 180 3.07 3.730 17.60  0  0    3    3
#> Merc 450SLC         15.2   8 275.8 180 3.07 3.780 18.00  0  0    3    3
#> Cadillac Fleetwood  10.4   8 472.0 205 2.93 5.250 17.98  0  0    3    4
#> Lincoln Continental 10.4   8 460.0 215 3.00 5.424 17.82  0  0    3    4
#> Chrysler Imperial   14.7   8 440.0 230 3.23 5.345 17.42  0  0    3    4
#> Fiat 128            32.4   4  78.7  66 4.08 2.200 19.47  1  1    4    1
#> Honda Civic         30.4   4  75.7  52 4.93 1.615 18.52  1  1    4    2
#> Toyota Corolla      33.9   4  71.1  65 4.22 1.835 19.90  1  1    4    1
#> Toyota Corona       21.5   4 120.1  97 3.70 2.465 20.01  1  0    3    1
#> Dodge Challenger    15.5   8 318.0 150 2.76 3.520 16.87  0  0    3    2
#> AMC Javelin         15.2   8 304.0 150 3.15 3.435 17.30  0  0    3    2
#> Camaro Z28          13.3   8 350.0 245 3.73 3.840 15.41  0  0    3    4
#> Pontiac Firebird    19.2   8 400.0 175 3.08 3.845 17.05  0  0    3    2
#> Fiat X1-9           27.3   4  79.0  66 4.08 1.935 18.90  1  1    4    1
#> Porsche 914-2       26.0   4 120.3  91 4.43 2.140 16.70  0  1    5    2
#> Lotus Europa        30.4   4  95.1 113 3.77 1.513 16.90  1  1    5    2
#> Ford Pantera L      15.8   8 351.0 264 4.22 3.170 14.50  0  1    5    4
#> Ferrari Dino        19.7   6 145.0 175 3.62 2.770 15.50  0  1    5    6
#> Maserati Bora       15.0   8 301.0 335 3.54 3.570 14.60  0  1    5    8
#> Volvo 142E          21.4   4 121.0 109 4.11 2.780 18.60  1  1    4    2
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reprex 包(v0.2.1)于 2019 年 3 月 4 日创建

虽然这对于未修改的数据框没有用,但如果您在到达 ggplot 之前通过一系列mutate()'s 或summarize()'s进行管道传输,这在事后显示数据可能很有用。

  • 它对于任何工作的外部函数也很有用,例如模型,在内部修改数据,然后生成 ggplot 作为输出。刚刚使用了你对“interactions::cat_plot”的答案,就像一个魅力。 (2认同)