NetworkX - 创建属于4节点集团的所有节点的新图形

Question

我有一个网络,我想受集团约束,但我还没有弄清楚如何正确地做到这一点.我能够使用k-cores执行相同的过程,但不确定创建仅包含clique的图形的正确过程.

我希望如果我使用该k_core函数显示我的查找子图的过程,有人可以帮助我改变我的过程以使用该clique函数查找子图.

首先,我创建一个图表,我将使用空手道俱乐部:

In [1]: import networkx as nx

In [2]: g = nx.karate_club_graph()

在iPython中绘制图表:

In [3]: pylab inline
Populating the interactive namespace from numpy and matplotlib

In [4]: nx.draw(g)

接下来,我找到4核内的所有边(有4个或更多边):

In [5]: g_4k_edges = nx.k_core(g, k=4).edges()

将这些边添加到新图:

In [6]: g_4k = nx.Graph()
In [7]: g_4k.add_edges_from(g_4k_edges)

绘制4核图:

In [8]: nx.draw(g_4k)

关于如何做到这一点的任何想法,但不是使用k核来绑定网络,而是使用具有4个或更多顶点的派系？

Answer 1

这是使用cliques生成子图的一种方法.

import networkx as nx

g = nx.karate_club_graph()

查找4个或更多节点的所有派系:

cliques = nx.find_cliques(g)
cliques4 = [clq for clq in cliques if len(clq) >= 4]

g从所有足够大的派系中创建一个子图:

nodes = set(n for clq in cliques4 for n in clq)
h = g.subgraph(nodes)

丢弃h程度小于4的节点:

deg = nx.degree(h)
nodes = [n for n in nodes if deg[n] >= 4]

所需图形k是h这些节点的子图:

k = h.subgraph(nodes)

这是所需图表的图像:

nx.draw(k)