mak*_*say 4 r package random-forest r-caret
在尝试使用插入符号包训练随机森林模型时,我注意到执行时间莫名其妙:
> set.seed = 1;
> n = 500;
> m = 30;
> x = matrix(rnorm(n * m), nrow = n);
> y = factor(sample.int(2, n, replace = T), labels = c("yes", "no"))
> require(caret);
> require(randomForest);
> print(system.time({rf <- randomForest(x, y);}));
user system elapsed
0.99 0.00 0.98
> print(system.time({rfmod <- train(x = x, y = y,
+ method = "rf",
+ metric = "Accuracy",
+ trControl = trainControl(classProbs = T)
+ );}));
user system elapsed
95.83 0.71 97.26
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
在我看来,执行时间应该只有10倍,因为默认情况下会发生10次交叉验证,而不是单次运行.我没有调整任何参数,但似乎火车自动完成:
> rfmod$results
mtry Accuracy Kappa AccuracySD KappaSD
1 2 0.4736669 -0.04437013 0.03323485 0.06493845
2 16 0.4818095 -0.03241901 0.03279341 0.06426745
3 30 0.4878361 -0.02149108 0.02956972 0.05936881
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
这最多可以解释30倍的差异.但是,它的运行时间要长近100倍.可能的解释是什么?
提前致谢
top*_*epo 10
你没有指定method
,trainControl
因此它默认为30次迭代的引导程序,因为tuneLength
也没有设置,你正在超过3个值mtry
.
当您将计算成本乘以90倍时,99.2449倍的加速应该不会出乎意料.
马克斯