如何在shell脚本中运行R代码？

Question

我有一个R文件(myfile.R).我想使用shell脚本运行它.我怎样才能做到这一点？我试过这个:

#! /bin/bash
Rscript myfile.R

但它给了我这个错误:Rscript:命令未找到

我也试过这个:

#! /bin/bash
R --not-save-- < myfile.R 

它也会出现此错误:R:找不到命令

最好的方法是什么？

Answer 1

我们的想法是不编写shell而是编写R脚本.这就是Rscript是,我们的利特勒封装,/usr/bin/r甚至在此之前.

所以就这么做

 #!/usr/bin/Rscript

 cat("Hello, world\n")
 # rest of your code below 

或使用

 #!/usr/bin/r

对于小家伙 - 我有多个cron工作就是这么做的.

显然,这假设你有Rscript或者r在/usr/bin,你会如定期的Debian或Ubuntu框.