使用XML包解决R内存泄漏问题

Question

我试图运行一些简单的程序从html代码中提取表.但是,XML包中的readHTMLTable似乎存在一些内存问题.有什么方法可以轻松地解决这个问题.就像以某种方式为这个命令指定一些特殊的内存然后手动释放它.

我试图把它放在一个函数中并尝试使用gc()和不同版本的R和这个包,似乎什么都没有用.我开始绝望了.

示例代码.如何在不爆炸内存大小的情况下运行它？

library(XML)
a = readLines("http://en.wikipedia.org/wiki/2014_FIFA_World_Cup")
while(TRUE) {
    b = readHTMLTable(a)
    #do something with b
}

编辑:这样的事情仍然占据了我的所有记忆:

library(XML)
a = readLines("http://en.wikipedia.org/wiki/2014_FIFA_World_Cup")
f <- function(x) {
    b = readHTMLTable(x)
    rm(x)
    gc()
    return(b)
}

for(i in 1:100) {
    d = f(a)
    rm(d)
    gc()
}
rm(list=ls())
gc()

我正在使用win 7并尝试使用32位和64位.

Answer 1

我在 XML 包中也遇到了很多内存泄漏问题（在 Windows 和 Linux 下），但我最终解决它的方法是在每个处理步骤结束时删除该对象，即添加一个 rm(b) 和每次迭代结束时的 gc() 。让我知道这是否也适合您。