mcl*_*fee 5 python performance numpy polynomials
我正在尝试使用numpy来评估多项式(3度).我发现通过更简单的python代码来实现它会更有效率.
import numpy as np
import timeit
m = [3,7,1,2]
f = lambda m,x: m[0]*x**3 + m[1]*x**2 + m[2]*x + m[3]
np_poly = np.poly1d(m)
np_polyval = lambda m,x: np.polyval(m,x)
np_pow = lambda m,x: np.power(x,[3,2,1,0]).dot(m)
print 'result={}, timeit={}'.format(f(m,12),timeit.Timer('f(m,12)', 'from __main__ import f,m').timeit(10000))
result=6206, timeit=0.0036780834198
print 'result={}, timeit={}'.format(np_poly(12),timeit.Timer('np_poly(12)', 'from __main__ import np_poly').timeit(10000))
result=6206, timeit=0.180546045303
print 'result={}, timeit={}'.format(np_polyval(m,12),timeit.Timer('np_polyval(m,12)', 'from __main__ import np_polyval,m').timeit(10000))
result=6206, timeit=0.227771043777
print 'result={}, timeit={}'.format(np_pow(m,12),timeit.Timer('np_pow(m,12)', 'from __main__ import np_pow,m').timeit(10000))
result=6206, timeit=0.168987989426
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我错过了什么?
numpy中还有另一种评估多项式的方法吗?
像23年前的事情,我从大学的图书馆查看了一份Press et al Numerical Recipes in C的副本.那本书中有很多很酷的东西,但这里有一段多年来一直困扰着我的文章,第173页:
我们假设你知道永远不会以这种方式评估多项式:
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)p=c[0]+c[1]*x+c[2]*x*x+c[3]*x*x*x+c[4]*x*x*x*x;或者(甚至更糟!),
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)p=c[0]+c[1]*x+c[2]*pow(x,2.0)+c[3]*pow(x,3.0)+c[4]*pow(x,4.0);来(计算机)革命,所有被认定犯有此类犯罪行为的人将被即决处决,他们的计划将不会!然而,这是一个品味问题,是否写作
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)p = c[0]+x*(c[1]+x*(c[2]+x*(c[3]+x*c[4])));要么
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)p = (((c[4]*x+c[3])*x+c[2])*x+c[1])*x+c[0];
因此,如果您真的担心性能,那么您希望尝试这一点,对于更高次多项式,差异将是巨大的:
In [24]: fast_f = lambda m, x: m[3] + x*(m[1] + x*(m[2] + x*m[3]))
In [25]: %timeit f(m, 12)
1000000 loops, best of 3: 478 ns per loop
In [26]: %timeit fast_f(m, 12)
1000000 loops, best of 3: 374 ns per loop
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如果你想坚持numpy,有一个更新的多项式类比poly1d我的系统运行速度快2倍,但仍然比前面的循环慢得多:
In [27]: np_fast_poly = np.polynomial.polynomial.Polynomial(m[::-1])
In [28]: %timeit np_poly(12)
100000 loops, best of 3: 15.4 us per loop
In [29]: %timeit np_fast_poly(12)
100000 loops, best of 3: 8.01 us per loop
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好吧,看看它的实现polyval(这是当你评估 poly1d 时最终被调用的函数),实现者决定包含一个显式循环似乎很奇怪......来自 numpy 1.6.2 的来源:
def polyval(p, x):
p = NX.asarray(p)
if isinstance(x, poly1d):
y = 0
else:
x = NX.asarray(x)
y = NX.zeros_like(x)
for i in range(len(p)):
y = x * y + p[i]
return y
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一方面,避免幂运算应该在速度方面是有利的,另一方面,Python 级循环几乎把事情搞砸了。
这是另一种 numpy-ish 实现:
POW = np.arange(100)[::-1]
def g(m, x):
return np.dot(m, x ** POW[m.size : ])
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为了速度,我避免在每次调用时重新创建电源阵列。另外,为了公平起见,在对 numpy 进行基准测试时,您应该从 numpy 数组而不是列表开始,以避免每次调用时将列表转换为 numpy 的惩罚。
所以,当添加时m = np.array(m),我的g上面的运行速度只比你的慢 50% 左右f。
尽管在您发布的示例上速度较慢,但为了评估标量上的低次多项式x,您确实不能比显式实现(例如您的f)做得更快(当然可以,但如果不诉诸于,可能不会快很多)编写较低级别的代码)。然而,对于更高的度数(您必须用某种循环替换显式表达式),g随着度数的增加,numpy 方法(例如 )将证明更快,并且对于矢量化评估(即何时x是矢量)来说也是如此。
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