使用roxygen2 R CMD检查codoc错配警告记录参考类

Question

我正在尝试使用roxygen2为引用类对象创建文档,但是当我运行R CMD检查时,我不断收到此警告:

  S4 class codoc mismatches from documentation object 'myRefClass-class':
  Slots for class 'myRefClass'
  Code: .xData
  Inherited: .xData
  Docs: field1 field2

这是与上述警告相关的ref class和roxygen2块:

#' @title myRefClass class
#' @description Description of myRefClass
#' @import methods
#' @exportClass myRefClass
#' @slot field1 A character slot
#' @slot field2 A numeric slot
myRefClass<-setRefClass(Class="myRefClass", 
                        fields=list(field1="character", 
                        field2="numeric"))

以下是生成的R文档:

myRefClass-class {testPackaging} R文档myRefClass类

描述

myRefClass的描述

老虎机

field1字符槽

field2数字槽

至于我能找到的文档,codoc正在测试我的代码和文档之间的一致性.据我所知,所有的插槽名称都是一样的; 也许我错过了什么.不确定文档是否应该自动将其标记为引用类,或者我是否应该以某种方式指出？我发现R文档表明插槽".xData用于启用异常类型的继承",但我不确定为什么它适用于我在这里做的或者我应该用它做什么.

我已经尝试了一些roxygen标签的排列并且保持接近这里发现的结构似乎给了我最好的结果/来自R CMD检查的最少警告:Roxygen2 - 如何@export参考类生成器？ 我一直在网上寻找roxygen2应该如何与参考类一起使用的例子; 也许我正在寻找错误的地方 - 我运气不好.

我正在使用roxygen2 v 3.1.0/RStudio版本0.98.501/R版本3.0.3/OSX 10.9.2(注意:尝试升级到roxygen2 v 4.0并且它在引用类上完全被阻塞,以至于没有文档存在根本生成)

如果有人知道使用roxygen2和引用类的CRAN包,那么我可能会看到它是如何正确完成的,或者如果有人知道我做错了什么,那么帮助将非常感激.我是R的包装建筑的新手.

Answer 1

@section Fields在这种情况下我通常使用一个:

#' @title myRefClass class
#' @description Description of myRefClass
#' @import methods
#' @exportClass myRefClass
#' @section Fields:
#' \describe{
#' \item{\code{field1}:}{Object of class \code{"character"}, field1 description here}
#' \item{\code{field2}:}{Object of class \code{"numeric"}, field2 description here}
#' }

myRefClass<-setRefClass(Class="myRefClass", 
                        fields=list(field1="character", 
                        field2="numeric"))

更新:使用roxygen2 4.0.1

#' A Reference Class to represent test1.
#' @name test1
#' @import methods
#' @exportClass myRefClass
#' @field field1 A character vector
#' @field field2 A numeric vector

myRefClass<-setRefClass(Class="myRefClass", 
                        fields=list(field1="character", 
                                    field2="numeric"))

产生

A Reference Class to represent test1.
Description

A Reference Class to represent test1.
Fields

field1

    A character vector
field2

    A numeric vector