Ell*_*iot 9 python simulation physics packages kinematics
我正在寻找一个python包,我可以用来模拟非平衡情况下的分子动力学.我需要一种能够以主要动力学理论方式处理相当多分子的装置,并且可以处理存在固体表面的装置.关于表面,我需要能够创建任意形状并监测由分子作用产生的压力和其他变量.或者,如果我有能够处理它的分子,我可以自己添加表面部分.
有谁知道任何可能适合的套餐？
你考虑过SimPy吗？SimPy 是一个相当通用的离散事件模拟包，但可以满足您的需求。
更好的是，分子建模工具包（MMTK）似乎更专业......
我都没有用过，但这听起来很有趣。Python 作为一种语言，似乎在仿真软件中处于有利地位，人们可以通过脚本编写模型的具体细节，同时依赖所有常见逻辑的框架，例如调度、可视化、监控等。当使用与生物模型相称的代理数量时，此类工具包的扩展能力如何（顺便说一句，那有多大？）
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