我确定这一定是重复的问题,但我在任何地方都找不到答案。我有一个包含多个字符串的列表,如下所示:
['>ctg7180000016561_3757\nAAAAATTTAGTTAAAACTATAACATTAGCTTGTCAAGCTAAAATTACTATGTAAGTAGTAATTTTTA\n', '>ctg7180000016561_3824\nATCCCTCAAATAGCACCCATTAACTGATTATCCTTATTCTTAATATTCACCACCTCTCTCCTAATATTTAGAGCTTCTAACTATTTCTTTATCATGTACCCCCCCAAAAAATCTGTTTTTTATAAAAAAACTAGTATAAATAACTGATCATGATAACTAACCTCTTTTCGTCTTTCGACCCCTCTACTAACTTAAATACTAACTTTAACTGAGTTAGGACTATCCTCGGGGTGGCTGTAATCCCGAGGATATTTTGGATTATCCCCTCGCGTTTCTCCCTGCTTTGAATAAAACTTATCAGTACTCTTCACAAAGAATTCAAAGTCCTTGTTAACAACAAAAAATCCCAAGGCAGAACCCTAATCCTGATTTCCTTATTTTCTATTATTTTATTTAATAACTTCATAGGACTATTCCCATATATTTTCACATCCACAAGTCACATAGTATTAACCCTGTCCCTGGCTCTCCCCATATGACTAAGATTTATATTGTATGGGTGGGTAAATAATACAACCCACATGCTAGCCCATCTAGTACCCCAAGGAACCCCTGCCGTTCTAATACCATTTATGGTGTGTATTGAAACAATCAGAAATGTTATCCGACCCGGCACCCTGGCAATCCGGCTATCCGCAAATATAATTGCAGGACACCTACTAATAACCCTTCTAGGTAACACGGGAAAC\n', '>ctg7180000016561_4513\nT\n']
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我要做的就是删除下划线后的数字,因此在此示例中,输出为:
['>ctg7180000016561\nAAAAATTTAGTTAAAACTATAACATTAGCTTGTCAAGCTAAAATTACTATGTAAGTAGTAATTTTTA\n', '>ctg7180000016561\nATCCCTCAAATAGCACCCATTAACTGATTATCCTTATTCTTAATATTCACCACCTCTCTCCTAATATTTAGAGCTTCTAACTATTTCTTTATCATGTACCCCCCCAAAAAATCTGTTTTTTATAAAAAAACTAGTATAAATAACTGATCATGATAACTAACCTCTTTTCGTCTTTCGACCCCTCTACTAACTTAAATACTAACTTTAACTGAGTTAGGACTATCCTCGGGGTGGCTGTAATCCCGAGGATATTTTGGATTATCCCCTCGCGTTTCTCCCTGCTTTGAATAAAACTTATCAGTACTCTTCACAAAGAATTCAAAGTCCTTGTTAACAACAAAAAATCCCAAGGCAGAACCCTAATCCTGATTTCCTTATTTTCTATTATTTTATTTAATAACTTCATAGGACTATTCCCATATATTTTCACATCCACAAGTCACATAGTATTAACCCTGTCCCTGGCTCTCCCCATATGACTAAGATTTATATTGTATGGGTGGGTAAATAATACAACCCACATGCTAGCCCATCTAGTACCCCAAGGAACCCCTGCCGTTCTAATACCATTTATGGTGTGTATTGAAACAATCAGAAATGTTATCCGACCCGGCACCCTGGCAATCCGGCTATCCGCAAATATAATTGCAGGACACCTACTAATAACCCTTCTAGGTAACACGGGAAAC\n', '>ctg7180000016561\nT\n']
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我正在使用正则表达式,并且具有完美的匹配,但是我无法解决如何实际删除子字符串。到目前为止,我的代码是:
pattern = re.compile('_[0-9]*')
for x in SequenceList:
re.sub(pattern, '', x)
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我知道这只是在更改变量x,但是即使我只是print x在for循环中,也不会删除模式。如何实际删除模式并更改列表?
谢谢,如果在某个地方已经回答了这个问题,对不起!
字符串是不可变的。这样,re.sub将创建一个新的字符串。相反,您可以使用列表推导来创建带有替换字符串的新列表,如下所示
import re
pattern = re.compile(r"_\d+")
print [pattern.sub("", item) for item in data]
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