Python中的类常量字典

Question

我正在构建一个具有类变量字典的模块：

class CodonUsageTable:
        CODON_DICT={'TTT': 0, 'TTC': 0, 'TTA': 0, 'TTG': 0, 'CTT': 0,
        'CTC': 0, 'CTA': 0, 'CTG': 0, 'ATT': 0, 'ATC': 0,
        'ATA': 0, 'ATG': 0, 'GTT': 0, 'GTC': 0, 'GTA': 0,
        'GTG': 0, 'TAT': 0, 'TAC': 0, 'TAA': 0, 'TAG': 0,
        'CAT': 0, 'CAC': 0, 'CAA': 0, 'CAG': 0, 'AAT': 0,
        'AAC': 0, 'AAA': 0, 'AAG': 0, 'GAT': 0, 'GAC': 0,
        'GAA': 0, 'GAG': 0, 'TCT': 0, 'TCC': 0, 'TCA': 0,
        'TCG': 0, 'CCT': 0, 'CCC': 0, 'CCA': 0, 'CCG': 0,
        'ACT': 0, 'ACC': 0, 'ACA': 0, 'ACG': 0, 'GCT': 0,
        'GCC': 0, 'GCA': 0, 'GCG': 0, 'TGT': 0, 'TGC': 0,
        'TGA': 0, 'TGG': 0, 'CGT': 0, 'CGC': 0, 'CGA': 0,
        'CGG': 0, 'AGT': 0, 'AGC': 0, 'AGA': 0, 'AGG': 0,

#Other code

        def __init__(self,seqobj):
                '''Creates codon table for a given Bio.seq object.i
                The only argument is Bio.Seq object with DNA
                Currently assumes seq to be DNA, RNA support to be added later'''
                dnaseq=str(seqobj)
                self.usage_table=CodonUsageTable.CODON_DICT.deepcopy()#instance of table

最后一行必须复制类字典以在其中存储实例数据，但它抛出

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "./codon_usage.py", line 47, in __init__
    self.usage_table=CodonUsageTable.CODON_DICT.deepcopy()#instance of codon usage table
NameError: global name 'CODON_DICT' is not defined

所以呢self.CODON_DICT，CODON_DICT或者codon_usage.CodonUsageTable.CODON_DICT，从调用时__init__。字典定义：

>>>import codon_usage
>>> codon_usage.CodonUsageTable.CODON_DICT
{'GCT': 0, 'GGA': 0, 'TTA': 0, 'GAT': 0, 'TTC': 0, 'TTG': 0, 'AGT': 0, 'GCG': 0, 'AGG': 0, 'GCC': 0, 'CGA': 0, 'GCA': 0, 'GGC': 0, 'GAG': 0, 'GAA': 0, 'TTT': 0, 'GAC': 0, 'TAT': 0, 'CGC': 0, 'TGT': 0, 'TCA': 0, 'GGG': 0, 'TCC': 0, 'ACG': 0, 'TCG': 0, 'TAG': 0, 'TAC': 0, 'TAA': 0, 'ACA': 0, 'TGG': 0, 'TCT': 0, 'TGA': 0, 'TGC': 0, 'CTG': 0, 'CTC': 0, 'CTA': 0, 'ATG': 0, 'ATA': 0, 'ATC': 0, 'AGA': 0, 'CTT': 0, 'ATT': 0, 'GGT': 0, 'AGC': 0, 'ACT': 0, 'CGT': 0, 'GTT': 0, 'CCT': 0, 'AAG': 0, 'CGG': 0, 'AAC': 0, 'CAT': 0, 'AAA': 0, 'CCC': 0, 'GTC': 0, 'CCA': 0, 'GTA': 0, 'CCG': 0, 'GTG': 0, 'ACC': 0, 'CAA': 0, 'CAC': 0, 'AAT': 0, 'CAG': 0}        'GGT': 0, 'GGC': 0, 'GGA': 0, 'GGG': 0}

Answer 1

这些症状暗示着故事是这样的：

1. 您编写了文件并保存了它；
2. 你运行了Python shell；
3. 你发现CODON_DICT不能像这样访问并修复它；
4. 您在同一个 Python shell 中再次尝试该调用并收到该错误。

发生这种情况是因为 Python 仍在使用旧版本的模块，该模块是在导入期间加载的。尽管它显示了新文件中的行，但由于内存中的所有内容都是带有元数据的字节码，并且在发生错误时必须引用磁盘。如果您想在不重新启动 shell 的情况下选择最新更改，请运行：

>>> reload(codon_usage)

然后再试一次。

（旁注：dict没有方法deepcopy，该函数来自模块copy。dict.copy不过，这里就足够了）。