处理apply和唯一的NA值

Question

我有一个114行到16列的数据框,其中行是个体,列是他们的名字或NA.例如,前3行如下所示:

            name name.1      name.2 name.3       name.4 name.5       name.6 name.7       name.8 name.9       name.10 name.11       name.12 name.13        name.14 name.15
1           <NA>   <NA>        <NA>   <NA>         <NA>   <NA>         <NA>   <NA>         <NA>   <NA>      Aanestad    <NA>      Aanestad    <NA>       Aanestad    <NA>
2           <NA>   <NA>        <NA>   <NA>         <NA>   <NA>         <NA>   <NA>     Ackerman   <NA>      Ackerman    <NA>      Ackerman    <NA>       Ackerman    <NA>
3           <NA>   <NA>        <NA>   <NA>         <NA>   <NA>      Alarcon   <NA>      Alarcon   <NA>       Alarcon    <NA>       Alarcon    <NA>           <NA>    <NA>

我想生成所有唯一名称的列表(如果每行有多个唯一名称)或向量(如果每行只有一个唯一名称),长度为114.

当我尝试时,apply(x,1,unique)我得到一个2xNcol数组,其中有时第一行单元格是NA,有时第二行单元格是NA.

    [,1]       [,2]       [,3]      [,4]     [,5]      [,6]      [,7]    [,8]   [,9]    
[1,] NA         NA         NA        NA       "Alquist" NA        "Ayala" NA     NA      
[2,] "Aanestad" "Ackerman" "Alarcon" "Alpert" NA        "Ashburn" NA      "Baca" "Battin"

当我想要的只是:

Aanestad
Ackerman
Alarcon
...

我似乎无法弄清楚如何在忽略NA时应用unique().na.rm,na.omit等似乎不起作用.我觉得我错过了一些简单的东西......

谢谢!

Answer 1

unique似乎没有na.rm参数,但您可以在调用之前自己删除缺失的值:

A <- matrix(c(NA,"A","A",
             "B", NA, NA,
              NA, NA, "C"), nr=3, byrow=TRUE)
apply(A, 1, function(x)unique(x[!is.na(x)]))

给

[1] "A" "B" "C"

Answer 2

您的初始解决方案非常非常接近.但正如Aniko所说,NA在使用unique之前你不要删除值.

我们首先创建一个类似的data.frame然后apply()像你一样使用的例子- 但是有一个额外的匿名函数用于组合na.omit()和unique():

R> DF <- t(data.frame(foo=sample(c(NA, "Foo"), 5, TRUE), 
                      bar=sample(c(NA, "Bar"), 5, TRUE)))
R> DF
    [,1]  [,2] [,3]  [,4]  [,5] 
foo "Foo" NA   "Foo" "Foo" "Foo"
bar NA    NA   NA    "Bar" "Bar"
R> apply(DF, 1, function(x) unique(na.omit(x)))
  foo   bar 
"Foo" "Bar"