安装包失败

Question

当尝试安装像ndl,minqa,RcppEigen,lme4等软件包时,我收到以下错误:

    install.packages("RcppEigen")
Installing package into ‘/home/matias/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0’
(as ‘lib’ is unspecified)
probando la URL 'http://cran.at.r-project.org/src/contrib/RcppEigen_0.3.2.0.2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1251504 bytes (1.2 Mb)
URL abierta
==================================================
downloaded 1.2 Mb

* installing *source* package ‘RcppEigen’ ...
** package ‘RcppEigen’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   -I"/home/matias/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/Rcpp/include"  -I../inst/include -fpic  -O3 -pipe  -g  -c RcppEigen.cpp -o RcppEigen.o
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   -I"/home/matias/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/Rcpp/include"  -I../inst/include -fpic  -O3 -pipe  -g  -c fastLm.cpp -o fastLm.o
g++ -shared -o RcppEigen.so RcppEigen.o fastLm.o Note: no visible binding for global variable '.Data' Note: no visible binding for global variable '.Data' -llapack -lblas -lgfortran -lm -lquadmath -L/usr/lib/R/lib -lR
g++: error: Note:: No existe el archivo o el directorio
g++: error: no: No existe el archivo o el directorio
g++: error: visible: No existe el archivo o el directorio
g++: error: binding: No existe el archivo o el directorio
g++: error: for: No existe el archivo o el directorio
g++: error: global: No existe el archivo o el directorio
g++: error: variable: No existe el archivo o el directorio
g++: error: '.Data': No existe el archivo o el directorio
g++: error: Note:: No existe el archivo o el directorio
g++: error: no: No existe el archivo o el directorio
g++: error: visible: No existe el archivo o el directorio
g++: error: binding: No existe el archivo o el directorio
g++: error: for: No existe el archivo o el directorio
g++: error: global: No existe el archivo o el directorio
g++: error: variable: No existe el archivo o el directorio
g++: error: '.Data': No existe el archivo o el directorio
make: *** [RcppEigen.so] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘RcppEigen’
* removing ‘/home/matias/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/RcppEigen’

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/RtmpzLOC7E/downloaded_packages’
Mensajes de aviso perdidos
In install.packages("RcppEigen") :
  installation of package ‘RcppEigen’ had non-zero exit status

我尝试重新安装R:

 sudo apt-get remove --purge r-base r-base-dev r-base-core
 sudo apt-get install r-base r-base-dev

我删除了R文件夹中的所有内容,但问题仍然存在.我接下来可以尝试什么？

Answer 1

我离R专家很远,但我在安装minqa时遇到了类似的问题,这是由于〜/ .Rprofile文件中的欢迎消息.事实证明(由于我不知道的原因)minqa的C++编译似乎将stdout直接传递给g ++,这是C++编译器.

您可以在错误消息中看到:

g++: error: Note:: No existe el archivo o el directorio
g++: error: no: No existe el archivo o el directorio
g++: error: visible: No existe el archivo o el directorio
g++: error: binding: No existe el archivo o el directorio
g++: error: for: No existe el archivo o el directorio
g++: error: global: No existe el archivo o el directorio
g++: error: variable: No existe el archivo o el directorio
g++: error: '.Data': No existe el archivo o el directorio

有些东西正在产生消息"注意:全局变量'.'''没有可见的绑定,它直接传递给g ++.如果你能以某种方式抑制这个警告信息,我的猜测是minqa然后会愉快地编译.

编辑:我刚刚意识到你通过重新安装Ubuntu解决了这个问题.那好吧.

Answer 2

看起来非常紧张.

现在,我在Ubuntu上开发/维护这些,所以你很有可能让它工作,除非你以某种方式炸毁你的系统.

先尝试一些简单的事情.在R中,请执行:

 R> library(Rcpp)
 R> evalCpp("2+2")   

你得到了我们期望的答案吗？如果没有,则表示您未进行编译.安装r-base-dev包作为开始.

如果everthing else失败,请使用我为lme4,RcppEigen,Rcpp,...维护的prebuild包.