Flask jsonify对象列表

Question

我有一个需要jsonify的对象列表.我看过烧瓶jsonify文档,但我只是没有得到它.

我班有几个研究所,增值经销商,每一个都是一个字符串:gene_id,gene_symbol,p_value.我需要做什么才能将其序列化为JSON？

我天真的代码:

jsonify(eqtls = my_list_of_eqtls)

结果是:

TypeError: <__main__.EqtlByGene object at 0x1073ff790> is not JSON serializable

据推测,我必须告诉jsonify如何序列化EqtlByGene,但我找不到一个示例来说明如何序列化一个类的实例.

这段代码现在有效(非常感谢Martijn Pieters!):

class EqtlByGene(Resource):

    def __init__(self, gene_id, gene_symbol, p_value):
        self.gene_id = gene_id
        self.gene_symbol = gene_symbol
        self.p_value = p_value

class EqtlJSONEncoder(JSONEncoder):
    def default(self, obj):
        if isinstance(obj, EqtlByGene):
            return {
                   'gene_id'     : obj.gene_id,
                   'gene_symbol' : obj.gene_symbol,
                   'p_value'     : obj.p_value
            }
        return super(EqtlJSONEncoder, self).default(obj)

class EqtlByGeneList(Resource):
    def get(self):
        eqtl1 = EqtlByGene(1, 'EGFR', 0.1)
        eqtl2 = EqtlByGene(2, 'PTEN', 0.2)
        eqtls = [eqtl1, eqtl2]
        return jsonify(eqtls_by_gene = eqtls)

api.add_resource(EqtlByGeneList, '/eqtl/eqtlsbygene')
app.json_encoder = EqtlJSONEncoder
if __name__ == '__main__':
    app.run(debug=True)

当我通过curl调用它时,我得到:

{
  "eqtls_by_gene": [
    {
      "gene_id": 1, 
      "gene_symbol": "EGFR", 
      "p_value": 0.1
    }, 
    {
      "gene_id": 2, 
      "gene_symbol": "PTEN", 
      "p_value": 0.2
    }
  ]
}

Answer 1

给你EqltByGene一个额外的方法来返回一个字典:

class EqltByGene(object):
    #

    def serialize(self):
        return {
            'gene_id': self.gene_id, 
            'gene_symbol': self.gene_symbol,
            'p_value': self.p_value,
        }

然后使用列表推导将对象列表转换为可序列化值列表:

jsonify(eqtls=[e.serialize() for e in my_list_of_eqtls])

另一种方法是为函数编写一个钩子函数json.dumps(),但由于你的结构相当简单,列表理解和自定义方法方法更简单.

你也可以真正冒险和亚类flask.json.JSONEncoder; 给它一个default()方法,将您的EqltByGene()实例转换为可序列化的值:

from flask.json import JSONEncoder

class MyJSONEncoder(JSONEncoder):
    def default(self, obj):
        if isinstance(obj, EqltByGene):
            return {
                'gene_id': obj.gene_id, 
                'gene_symbol': obj.gene_symbol,
                'p_value': obj.p_value,
            }
        return super(MyJSONEncoder, self).default(obj)

并将其分配给app.json_encoder属性:

app = Flask(__name__)
app.json_encoder = MyJSONEncoder

并直接将您的列表传递给jsonify():

return jsonify(my_list_of_eqtls)