将ff对象转换为data.frame

Question

我正在处理大型矩阵和ff包。我正在加载一个ff对象，我想用它来计算crps（分数）。

例如，我有一个ff_matrix（称为Mat，具有25行和7303列），它是降水预测（7303代表天数（约20年），而25是一天的25次降水模拟）。我还有一个ff_array，其中包含这20年的观测值（称为Obs，具有7303值）。

使用ensembleBMA软件包，我想计算CRPS。我需要将ff_matrix和ff_array放在“ ensembleBMA”对象中（实际上这是一个data.frame）。

对于此代码：

ensembleBMA(Mat,Obs)

我有这个错误：

Error in as.data.frame.default(x[[i]], optional = TRUE, stringsAsFactors = stringsAsFactors) : cannot coerce class 'c("ff_matrix", "ff_array", "ff")' into a data.frame

我尝试了其他选项，例如：

as.data.frame(Mat)
as.matrix(Mat)
transform.ffdf(as.ffdf(Mat))

我总是有这些错误：

Error in as.data.frame.default(Mat_Ptot_212_1) : cannot automatically convert class  'c("ff_matrix", "ff_array", "ff")' into a data frame (data.frame)

要么

opening ff /tmp/RtmpWrlY4n/clone9d3376b435.ff Error in ff(initdata = initdata, length = length, levels = levels, ordered = ordered,  : write error

有人有主意吗？

Answer 1

我们首先将您的数据转换ff_array为数组并将其转换为 a 的一种方法data.frame：

Mat <- ff(1, vmode="double", dim=c(25, 7303))
as.data.frame(Mat[,])

或者首先将您的转换ff_array为 anffdf并将其转换为 an data.frame：

 as.ffdf(Mat)[,]

或者

as.data.frame(as.ffdf(Mat))

最后两个解决方案似乎比第一个慢得多。这可能与大量的列有关，这会降低速度，as.ffdf从而创建 7303 个文件。

好像没有as.data.frame.ff_array。