读取CSV时自动将NAs转换为0

Question

为了节省空间,我从CSV文件中省略了零作为一种稀疏表示(所有数据都是数字):

table = read.csv(text = "
V1,V2,V3
0.3,1.2,1.5
0.5,,2.1
,.1,")

这是我得到的:

> table

   V1  V2  V3
1 0.3 1.2 1.5
2 0.5  NA 2.1
3  NA 0.1  NA

我可以继续将NAs更改为0:

table[is.na(table)] = 0

    V1  V2  V3
1: 0.3 1.2 1.5
2: 0.5 0.0 2.1
3: 0.0 0.1 0.0

只是想知道在阅读时是否有一个单行班,最好是data.table的fread？:

table = fread("
V1,V2,V3
0.3,1.2,1.5
0.5,,2.1
,.1,")

更多信息:我想避免的原因

table[is.na(table)] = 0

是因为对我的数据的执行速度非常快,这个操作非常慢!(不确定原因.)我的数据集是336行x 3939列.(G.格洛腾迪克的定制课程答案很快,谢谢你的想法!)

Answer 1

设置一个将空字段视为0的自定义类.鉴于设置它只是一行read.csv语句来读取数据:

# test data
Lines <- "V1,V2,V3
0.3,1.2,1.5
0.5,,2.1
,.1,
"

# set up custom class
setClass("empty.is.0")
setAs("character", "empty.is.0", 
      function(from) replace(as.numeric(from), from == "", 0))

# one liner
read.csv(text = Lines, strip.white = TRUE, colClasses = "empty.is.0")