R:合并data.table并填写NA

Question

假设有3个数据表:

dt1<-data.table(Type=c("a","b"),x=1:2)
dt2<-data.table(Type=c("a","b"),y=3:4)
dt3<-data.table(Type=c("c","d"),z=3:4)

我想将它们合并到1个数据表中,所以我这样做:

dt4<-merge(dt1,dt2,by="Type") # No error, produces what I want
dt5<-merge(dt4,dt3,by="Type") # Produces empty data.table (0 rows) of 4 cols: Type,x,y,z

有没有办法让dt5代替这样？:

> dt5
   Type x y z
1:    a 1 3 NA
2:    b 2 4 NA
3:    c NA NA 3
4:    d NA NA 4

Answer 1

如果您事先知道列中的唯一值,则Type可以使用J,然后按照表的data.table方式连接表.你应该为每个表设置密钥,以便data.table知道要加入什么,就像这样......

#  setkeys
setkey( dt1 , Type )
setkey( dt2 , Type )
setkey( dt3 , Type )


#  Join
dt1[ dt2[ dt3[ J( letters[1:4] ) , ] ] ]
#   Type  x  y  z
#1:    a  1  3 NA
#2:    b  2  4 NA
#3:    c NA NA  3
#4:    d NA NA  4

这显示了邪恶data.table的复合查询(即dt1[dt2[dt3[...]]])!

如果您事先不知道关键列的唯一值,您可以列出表格并使用lapply它们快速浏览它们获取唯一值来J表达您的表达...

#  A simple way to get the unique values to make 'J',
#  assuming they are in the first column.
ll <- list( dt1 , dt2 , dt3 )
vals <- unique( unlist( lapply( ll , `[` , 1 ) ) )
#[1] "a" "b" "c" "d"

然后像以前一样使用它,即dt1[ dt2[ dt3[ J( vals ) , ] ] ].

Answer 2

在您探讨all争论的同时merge,我还会为您提供一个可能需要考虑的替代方案:

Reduce(function(x, y) merge(x, y, by = "Type", all = TRUE), list(dt1, dt2, dt3))
#    Type  x  y  z
# 1:    a  1  3 NA
# 2:    b  2  4 NA
# 3:    c NA NA  3
# 4:    d NA NA  4