为什么reshape2的Melt无法在变换中捕获rownames？

Question

我有以下数据:

Cubn    3.71455160837536    0.237454645363458
Gm9779  2.56051657980096    0.20850752817264
Apod    3.51796703048962    0.195999214485821

我想要做的是创建'融化'数据,以便它给出这个

       var1 var2     value
1      FOO Cubn   3.7145516
2      FOO Gm9779 2.5605166
3      FOO Apod   3.5179670
4      BAR Cubn   0.2374546
5      BAR Gm9779 0.2085075
6      BAR Apod   0.1959992

但为什么这会失败？

 library("reshape2");
 dat <-read.table("http://dpaste.com/1446132/plain/",header=FALSE)
 rownames(dat) <- dat[,1]
 dat[,1] <- NULL
 colnames(dat) <- c("FOO","BAR");
 head(dat)
 longData <- melt(dat);
 head(longData)

Answer 1

我不知道为什么部分,但我知道你可以melt通过一个matrix而不是一个来获得行名data.frame:

melt(as.matrix(dat))
#     Var1 Var2     value
# 1   Cubn  FOO 3.7145516
# 2 Gm9779  FOO 2.5605166
# 3   Apod  FOO 3.5179670
# 4   Cubn  BAR 0.2374546
# 5 Gm9779  BAR 0.2085075
# 6   Apod  BAR 0.1959992

你必须查看melt函数的代码才能知道它为什么会这样.特别是,代码reshape2:::melt.matrix具有以下行,这些行将在上面的示例中创建前两列:

labels <- expand.grid(lapply(dn, var.convert), KEEP.OUT.ATTRS = FALSE, 
    stringsAsFactors = FALSE)