如何在不知道Rcpp类型的情况下处理向量

Question

我想复制以下R函数Rcpp:

fR = function(x) x[1:2]

fR(c(1,2,3))
#[1] 1 2
fR(c('a','b','c'))
#[1] "a" "b"

我可以这样做固定输出类型,如下所示:

library(inline)
library(Rcpp)

fint = cxxfunction(signature(x = "SEXP"), '
          List xin(x);
          IntegerVector xout;

          for (int i = 0; i < 2; ++i) xout.push_back(xin[i]);

          return xout;', plugin = "Rcpp")

但是这只适用于整数,如果我尝试用(或者,它们是相同的)替换xout类型- 它适用于任何输入类型,但我得到一个而不是一个向量.ListGenericVectorlist

Rcpp这样做的正确方法是什么？

Answer 1

不要push_back在Rcpp类型上使用.当前实现Rcpp向量的方式需要每次都复制所有数据.这是一项非常昂贵的操作.

我们有RCPP_RETURN_VECTOR用于调度,这要求您编写一个模板函数,将Vector作为输入.

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp ;

template <int RTYPE>
Vector<RTYPE> first_two_impl( Vector<RTYPE> xin){
    Vector<RTYPE> xout(2) ;
    for( int i=0; i<2; i++ ){
        xout[i] = xin[i] ;    
    }
    return xout ;
}

// [[Rcpp::export]]
SEXP first_two( SEXP xin ){
  RCPP_RETURN_VECTOR(first_two_impl, xin) ;
}

/*** R
    first_two( 1:3 )
    first_two( letters )
*/

只需sourceCpp这个文件,这也将运行调用这两个函数的R代码.实际上,模板可能更简单,这也可以工作:

template <typename T>
T first_two_impl( T xin){
    T xout(2) ;
    for( int i=0; i<2; i++ ){
        xout[i] = xin[i] ;    
    }
    return xout ;
}

模板参数T只需要:

• 一个构造函数 int
• 一个 operator[](int)

或者,这可能是dplyr矢量访问者的工作.

#include <dplyr.h>
// [[Rcpp::depends(dplyr,BH)]]

using namespace dplyr ;
using namespace Rcpp ;

// [[Rcpp::export]]
SEXP first_two( SEXP data ){
    VectorVisitor* v = visitor(data) ;
    IntegerVector idx = seq( 0, 1 ) ;
    Shield<SEXP> out( v->subset(idx) ) ;
    delete v ;
    return out ;
}

访问者允许您在向量上执行一组操作,而不管它包含的数据类型.

> first_two(letters)
[1] "a" "b"

> first_two(1:10)
[1] 1 2

> first_two(rnorm(10))
[1] 0.4647190 0.9790888