gigapixel图像的自描述文件格式?

Ada*_*ode 7 tiff tiles image

在医学成像中,似乎存在两种存储巨大的千兆像素图像的方式:

  1. 使用大量JPEG图像(打包成文件或单独打印)并制作一些奇怪的索引格式来描述其中的内容.以某种其他格式处理一些元数据.

  2. 使用TIFF的图块和多图像支持将图像干净地存储为单个文件,并提供缩放采样版本以实现缩放速度.然后滥用各种TIFF标签以非标准方式存储元数据.此外,存储具有重叠边界的切片,必须稍后单独翻译.

在这两种情况下,读者必须充分了解格式,以了解如何绘制内容和阅读元数据.

有没有更好的方法来存储这些图像?TIFF(或BigTIFF)仍然是正确的格式吗?XMP是否解决了元数据问题?

主要问题是:

  • 以允许快速随机访问(平铺)的方式存储图像
  • 存储下采样图像以进行快速缩放(金字塔)
  • 处理瓷砖重叠或稀疏的情况(扫描仪通常通过在2D中的幻灯片上移动相机并仅捕获有图像的位置来工作)
  • 存储重要的元数据,包括相关图像,如幻灯片的标签和缩略图
  • 支持有损存储

人们使用什么样的(希望是非专有的)格式来存储大型航空照片或地图?这些图像具有相似的属性.

Ada*_*ode 5

它似乎从TIFF或BigTIFF开始,并定义一个有用的标签子集+ XMP元数据可能是要走的路.FITS是不好的,因为它基本上是无损数据,并且没有非常合适的元数据机制.

TIFF的问题在于它只是允许太多的灵活性,但是TIFF的子集应该是可接受的.

解决方案很可能是http://ome-xml.org/http://ome-xml.org/wiki/OmeTiff.

看起来DICOM现在有支持:ftp: //medical.nema.org/MEDICAL/Dicom/Final/sup145_ft.pdf