Lapack链接错误,使用-fPIC重新编译

Question

我有一个用Levenberg-Marquardt方法拟合非线性函数的复杂程序.

该程序使用来自Lapack库的线性方程组的求解器,我使用过:

extern "C" ...

链接到外部fortran库.该程序在我的笔记本电脑上运行没有问题(使用Ubuntu 12.04),我一直在使用它进行测试.

问题:

现在我搬到了大胖64核计算机上才开始做一些真正的计算,计算机上有一个科学的linux 6就可以了.事实证明,大型计算机没有安装lapack,所以我得到了lapack 3.4.2,编译它,并按照这里的说明构建它:

http://matrixprogramming.com/2011/04/using-lapack-from-c/comment-page-1

在那之后,我在之前工作的cmake文件中完全没有改变,只是添加了链接选项:

-L/xdata/Compilers/Sources/lapack-3.4.2

现在我收到错误:

/usr/bin/ld: /xdata/Compilers/Sources/lapack-3.4.2/liblapack.a(dsytrf.o): relocation R_X86_64_32 against `.rodata' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC

只是为了记录,我的cmake脚本到处都是-fPIC和-fPIE ...我使用它的链接:

target_link_libraries(LibsModule -lgsl)
target_link_libraries(LibsModule -lgslcblas)
target_link_libraries(LibsModule -lrt)
target_link_libraries(LibsModule -lpthread)
target_link_libraries(LibsModule -pie)
target_link_libraries(LibsModule -fPIC)
target_link_libraries(LibsModule -L/xdata/Compilers/Sources/lapack-3.4.2)
target_link_libraries(LibsModule -lgfortran)
target_link_libraries(LibsModule -llapack -fPIC)
target_link_libraries(LibsModule -lblas -fPIC)

我做错了什么？请指教.

谢谢.

Answer 1

解决方案是使用-fPIC重新编译lapack本身.所以在你的make.inc中更改为以下内容:

FORTRAN  = gfortran -m64 -fPIC
OPTS     = -O2 -m64 -fPIC
DRVOPTS  = $(OPTS)
NOOPT    = -O0 -m64 -fPIC
LOADER   = gfortran -m64 -fPIC

你也可以使用-O3更好的优化,它工作正常!

该选项-m64取决于您是否要使用64位系统.你的选择!

干杯!