从R中的相关向量创建相关矩阵

Question

我想在给定相关向量的情况下创建相关矩阵,相关向量是相关矩阵的上(或下)三角矩阵.

目标是转换此向量

这个相关矩阵在对角线上有1s.

你知道是否有一种方法创建一个矩阵给定对角线上方的三角形并将对角线设置为1？

Answer 1

我不知道是否有自动方式来做到这一点,但扩展我的评论:

myvec <- c(-.55, -.48, .66, .47, -.38, -.46)
mempty <- matrix(0, nrow = 4, ncol = 4)
mindex <- matrix(1:16, nrow = 4, ncol = 4)
mempty[mindex[upper.tri(mindex)]] <- myvec
mempty[lower.tri(mempty)] <- t(mempty)[lower.tri(t(mempty))]
diag(mempty) <- 1
mempty
#       [,1]  [,2]  [,3]  [,4]
# [1,]  1.00 -0.55 -0.48  0.47
# [2,] -0.55  1.00  0.66 -0.38
# [3,] -0.48  0.66  1.00 -0.46
# [4,]  0.47 -0.38 -0.46  1.00

这是一个快速入侵的功能.我希望我的所有数学步骤都是正确的!

vec2symmat <- function(invec, diag = 1, byrow = TRUE) {
  Nrow <- ceiling(sqrt(2*length(invec)))

  if (!sqrt(length(invec)*2 + Nrow) %% 1 == 0) {
    stop("invec is wrong length to create a square symmetrical matrix")
  }

  mempty <- matrix(0, nrow = Nrow, ncol = Nrow)
  mindex <- matrix(sequence(Nrow^2), nrow = Nrow, ncol = Nrow, byrow = byrow)
  if (isTRUE(byrow)) {
    mempty[mindex[lower.tri(mindex)]] <- invec
    mempty[lower.tri(mempty)] <- t(mempty)[lower.tri(t(mempty))]
  } else {
    mempty[mindex[upper.tri(mindex)]] <- invec
    mempty[lower.tri(mempty)] <- t(mempty)[lower.tri(t(mempty))]
  }

  diag(mempty) <- diag
  mempty
}

这里对角线的值不同.

vec2symmat(1:3, diag = NA)
#      [,1] [,2] [,3]
# [1,]   NA    1    2
# [2,]    1   NA    3
# [3,]    2    3   NA

如果您尝试提供无法创建方阵的数据,则会出现错误消息.

vec2symmat(1:4)
# Error in vec2symmat(1:4) : 
#   invec is wrong length to create a square symmetrical matrix

并且,使用默认设置.

vec2symmat(1:10)
#      [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
# [1,]    1    1    2    3    4
# [2,]    1    1    5    6    7
# [3,]    2    5    1    8    9
# [4,]    3    6    8    1   10
# [5,]    4    7    9   10    1

Answer 2

你可以说服R你的向量是一个距离对象然后as.matrix用来转换它:

> myvec <- c(-.55, -.48, .66, .47, -.38, -.46)
> class(myvec) <- 'dist'
> attr(myvec,'Size') <- 4
> as.matrix(myvec)
      1     2     3     4
1  0.00 -0.55 -0.48  0.66
2 -0.55  0.00  0.47 -0.38
3 -0.48  0.47  0.00 -0.46
4  0.66 -0.38 -0.46  0.00

或@AnandaMahto答案的变体(类似于上面使用的内部):

> myvec <- c(-.55, -.48, .66, .47, -.38, -.46)
> mycor <- matrix(0,4,4)
> mycor[ col(mycor) < row(mycor) ] <- myvec
> mycor <- mycor + t(mycor)
> diag(mycor) <- 1
> mycor
      [,1]  [,2]  [,3]  [,4]
[1,]  1.00 -0.55 -0.48  0.66
[2,] -0.55  1.00  0.47 -0.38
[3,] -0.48  0.47  1.00 -0.46
[4,]  0.66 -0.38 -0.46  1.00