查找间隔(段)的成对重叠

Ali*_*Ali 5 algorithm performance r segments intervals

我们给出了两组间隔AB.按间隔,我的意思是一对有序的整数,如c(2,5).我想找到所有间隔对 - 一个来自A和一个B- 有重叠.

例如,如果A和B如下:

A=c(c(1,7), c(2,5), c(4, 16))
B=c(c(2,3), c(2,20))
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

然后FindOverlap(A, B)应返回如下的矩阵(唯一的零元素是因为第3个间隔A与第一个间隔不重叠B):

1 1
1 1
0 1
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你有什么有效的想法吗?

小智 6

interval包似乎在这里提供了一个解决方案:

require("intervals")
A <- rbind(A1=c(1,7), A2=c(2,5), A3=c(4, 16))
B <- rbind(B1=c(2,3), B2=c(2,20))

# here you can also define if it is an closed or open interval
Aint <- Intervals(A)
Bint <- Intervals(B)

# that should be what you are looking for    
interval_overlap(Aint, Bint)
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一个很好的演示