使用R，如何在不打开文件的情况下找到文件中特定短语的行号？

Question

我是R的新手。我有一个很大的（3.2 Gb）txt文件，其中包含两列。第一列具有人类基因组序列的位置，第二列具有与每个位置相对应的值。我想从第一列中查找特定位置的行号，然后将这些行读入R中的表中。由于内存问题，我无法导入文件。这是R代码的示例，我尝试从数据文件的第一列获取一个特定位置的行号。数据文件称为my.data。

con <- file("my.data",open="r");
grep("13108", con)

grep不起作用。

如果有人可以告诉我正确的代码，我将不胜感激。

Answer 1

尝试以下方法：

read.csv(pipe("grep 13108 my.data"), ...)

（根据您的数据填写适当的参数）