我有一个R脚本,使用ggsave保存一些图.当我从命令行运行脚本时,它不仅保存我的图,而且还保存一个空的Rplots.pdf文件.如何防止R创建这个不必要的文件？
这是一个重现错误的示例脚本:
#!/usr/bin/env Rscript
# Code that creates unnecessary Rplots.pdf file
library(ggplot2)
my.data <- data.frame(x = 1:10, y = 1:10)
my.plot <- qplot(x, y, data = my.data)
ggsave('example.png', my.plot)
以下所有运行脚本的方法都会创建不必要的文件:
Rscript script.R
Rscript --vanilla script.R
chmod a+x script.R
./script.R
此外,当我从交互式会话中获取代码时,将打开一个不必要的空白R图形设备窗口.
此外,如果我使用以下更详细的代码代替ggsave,我没有这些问题:
#!/usr/bin/env Rscript
# Code that does NOT create unnecessary Rplots.pdf file
library(ggplot2)
my.data <- data.frame(x = 1:10, y = 1:10)
my.plot <- qplot(x, y, data = my.data)
png(file = 'example.png')
print(my.plot)
dev.off()
这是我的会话信息(无论是运行Rscript还是以交互方式运行):
R version 3.0.1 (2013-05-16)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
[7] LC_PAPER=C LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] methods stats graphics grDevices utils datasets base
other attached packages:
[1] ggplot2_0.9.3.1
loaded via a namespace (and not attached):
[1] colorspace_1.2-2 dichromat_2.0-0 digest_0.6.3 grid_3.0.1
[5] gtable_0.1.2 labeling_0.1 MASS_7.3-26 munsell_0.4
[9] plyr_1.8 proto_0.3-10 RColorBrewer_1.0-5 reshape2_1.2.2
[13] scales_0.2.3 stringr_0.6.2
5年后更新(2018-08-02):这个问题来来去去.ggplot2 2.2.1不会产生空文件,ggplot2 3.0.0会产生,而ggplot2团队目前正在努力解决这个问题.有关开发历史记录,请参阅ggplot2问题#1326,#2363,#2758和#2787.
jor*_*ran 20
如果你查看宽度和高度参数的默认值ggsave,你会发现它们是par("din")[1]和par("din")[2].如果您在控制台中运行它,您将看到它打开一个图形窗口,如果尚未打开.
这种方式很有意义,因为为了获得设备宽度/高度(英寸),您需要一个实际的设备.我想有人可能会争辩说,par("din")如果没有设备打开就应该返回一个错误,在这种情况下,哈德利肯定会以ggsave不同的方式写出来.
的确,来自?par:
如果当前设备是空设备,则par将在查询/设置参数之前打开新设备.
因此,指定宽度/高度将防止伪装置打开.