Python和Numba用于矢量化函数

Question

美好的一天,我正在为一些数字工作编写一个Python模块.由于有很多事情要发生,我过去几天一直在优化代码以改善计算时间.但是,我有一个关于Numba的问题.基本上,我有一个类,其中一些字段是numpy数组,我按以下方式初始化:

def init(self):
    a = numpy.arange(0, self.max_i, 1)
    self.vibr_energy = self.calculate_vibr_energy(a)

def calculate_vibr_energy(i):
    return numpy.exp(-self.harmonic * i - self.anharmonic * (i ** 2))

因此,代码是矢量化的,使用Numba的JIT会带来一些改进.但是,有时我需要从类外部访问calculate_vibr_energy函数,并传递单个整数而不是数组来代替i.据我所知,如果我在calculate_vibr_energy上使用Numba的JIT,它必须始终将数组作为参数.

那么,以下哪个选项更好:1)创建一个新函数calculate_vibr_energy_single(i),它只取一个整数,并在其上使用Numba 2)替换与此类似的函数的所有用法:

myclass.calculate_vibr_energy(1)

有了这个:

tmp = np.array([1])
myclass.calculate_vibr_energy(tmp)[0]

或者还有其他更有效(或至少更多的Python-ic)方法吗？

Answer 1

我只玩过一点 numba，所以我可能会弄错，但据我所知，使用“autojit”装饰器应该给出可以接受任何类型参数的函数。

参见例如http://numba.pydata.org/numba-doc/dev/pythonstuff.html