安装旧版R包

Question

我试图使用Rpy2和ggplot2,但我收到一个错误.在网上搜索了一些错误后,我发现错误的发生是因为ggplot2包中的更改尚未反映在Rpy2中(例如,请参阅此帖子(编辑:链接现已死)).

所以我现在需要安装旧版本的ggplot2.这是我想要的伪代码:

install.packages("ggplot2", version='0.9.1')

但install.packages没有version争论.我该怎么做？

Answer 1

要从源代码安装旧版本的软件包(在R中):

packageurl <- "http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggplot2/ggplot2_0.9.1.tar.gz"
install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source")

如果这对您不起作用并且您在Windows上,那么原因可能是缺少用于构建/编译包的适当工具链.通常,您将从CRAN安装预编译的二进制文件,但它们只归档包源,而不是二进制文件.^[1]这意味着您需要安装Rtools才能在本地编译所有内容.(注意:Rtools 不是R包.)

@ shadow的答案下面也说明了你可以使用的情况devtools::install_version().这也是一个好主意,但也需要在Windows上使用Rtools.

截至2015年9月18日,CRAN上出现了新的软件包版本.这依赖于Revolution Analytics MRAN服务器来安装特定版本或日期的包:

# install yesterday's version of checkpoint, by date
install.dates('checkpoint', Sys.Date() - 1)

# install earlier versions of checkpoint and devtools
install.versions(c('checkpoint', 'devtools'), c('0.3.3', '1.6.1'))

这样做的好处是不需要Rtools在Windows上安装二进制包,但只能在2014-09-17(MRAN启动时)工作.

要从命令行(R外部)安装旧版本:

R CMD INSTALL一旦在计算机上本地拥有包源("tarball"),您也可以在命令行(终端,命令提示符等)上使用安装包,例如使用wget(如果有):

wget http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggplot2/ggplot2_0.9.1.tar.gz

或者,如果您使用的是Windows,则使用PowerShell的等价物将是:

(new-object System.Net.WebClient).DownloadFile("http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggplot2/ggplot2_0.9.1.tar.gz", "./ggplot2_0.9.1.tar.gz")

或者您可以通过Web浏览器从CRAN存档下载源代码.

要从本地文件安装,您可以执行以下操作:

R CMD INSTALL ggplot2_0.9.1.tar.gz

这应该可以在任何平台上工作(与上面相同 - 需要一个工具链来构建包).

^[1] _{这已不再完全正确.从2016年3月开始,CRAN开始托管"CRAN Archive"服务器,该服务器包含适用于旧版本R(> 5年)的Windows和Mac二进制文件.您现在可以使用直接从此服务器安装install.packages().有关详细信息,请参阅新的R FAQ 7.44.}

Answer 2

该devtools软件包提供了一个install_version可以直接执行此操作的功能.

require(devtools)
install_version("ggplot2", version = "0.9.1", repos = "http://cran.us.r-project.org")

Answer 3

纯install.packages法

请参阅r-devel 邮件列表上的此主题。在回复 Kurt Wheeler 时，Kurt Hornik 透露了 CRAN 网站的一个未记录的功能，用于指定软件包的特定版本。

只要您已经安装了所有必需的依赖项，此方法就可以工作：

package = "https://cran.r-project.org/package=svglite&version=1.2.1"
utils::install.packages(pkgs = package, repos = NULL)

请注意上面的 URL 结构。这解决了 CRAN 最新版本的 URL 结构与存档版本不同的问题：

# Latest version (not available at Archive/svglite)
https://cran.r-project.org/src/contrib/svglite_1.2.1.tar.gz
# Archived version
https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/svglite/svglite_1.2.0.tar.gz

remotes::install_version方法

另一种选择是使用该remotes::install_version 功能。但是，您需要安装该remotes 软件包。

Answer 4

对于 2014 年 9 月 17 日以来发布的软件包版本，有一个versions软件包可以大大简化此任务。它使用 Revolution Analytics 的 MRAN 服务器快照来：

• 显示任何 CRAN 软件包的发布日期和 MRAN 可用性 ( available.versions)，

• 安装一个或多个软件包的指定版本( install.versions)，或者

• 安装截至任何指定日期 ( install.dates) 可用的软件包版本。它通过标准功能从 MRAN 服务器进行安装install.packages，因此可以安装可用的二进制版本，而不必从源代码进行编译，并且可以包含截至指定日期的包依赖项。

当然，包版本和 R 版本的组合可能会存在兼容性问题。要运行不同的 R 版本，请参阅此页面的示例。

Answer 5

您可以从下面的链接以 zip 文件的形式下载合适的版本。

http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggplot2/

在 R Studio 中：工具 >> 安装包 >> 安装自：（选择下拉菜单）

包存档文件（.zip、.tar.gz）。

选择您新下载的包压缩文件并安装包

Answer 6

另一个选择是 {groundhog} 包。它可以通过指定日期来帮助从 CRAN 安装较旧的软件包版本。当人们不记得特定的软件包版本，而是记住脚本仍在运行的时间时，这尤其有用。如果 {ggplot2} 版本 0.9.1 于 2012 年 5 月加载到 CRAN 上，那么我们可以从 6 月开始计算日期。

library("groundhog")
groundhog.library("ggplot2", "2012-06-01")

Answer 7

使用install.packages另一个答案中描述的对我不起作用.

我找到的最好的选择是使用install_url包中的函数devtools.

我没有进一步探索的另一种可能性:

1. 从包存档中下载较旧的.tar.gz源文件.
2. 按照http://rtm.wustl.edu/writings/htrtargz.pdf上记录的步骤在本地安装.

Answer 8

找到了一个很好的解决方案，对我有用（详细信息位于链接）。

“repmis”库中的命令：

# Install old versions of the e1071 and gtools packages.

# Create vectors of the package names and versions to install
# Note the names and version numbers must be in the same order
Names <- c("e1071", "gtools")
Vers <- c("1.6", "2.6.1")

# Install old package versions into the default library
InstallOldPackages(pkgs = Names, versions = Vers)