R中的图像平滑

Question

如何在R中平滑此图片,以便只保留两个峰值？

如果这是1d数据,我会做一个运行平均值或适合它的回归函数.但我没有找到关于在二维矩阵上应用这些方法的非常具体的信息.例如,我试图filter()从stats包中使用.

我也考虑过克里金法,但这更多是关于插值的,是吗？

Answer 1

该软件包spatstat具有blur()应用高斯模糊的功能.这在某种程度上掩盖了图像,大部分噪声消失了,两个主峰明显可辨.

效果可以在下面的图片中看到并且非常显着,特别是在3d图中.

生成图片的代码是:

library(jpeg)
library(fields)
library(spatstat)

picture <- readJPEG("~/Downloads/spectrogram.png.jpeg")
picture2 <- as.matrix(blur(as.im(picture), sigma=6))

layout(matrix(c(1:4), nrow=2))
image.plot(picture, col=gray.colors(50), main="original image", asp=1)
image.plot(picture2, col=gray.colors(50), main="blurred with sigma = 6", asp=1)
drape.plot(1:nrow(picture), 1:ncol(picture), picture, border=NA, theta=0, phi=45, main="original spectrogram")
drape.plot(1:nrow(picture), 1:ncol(picture), picture2, border=NA, theta=0, phi=45, main="blurred with sigma = 6")

Answer 2

我想你应该看一下focalraster包中的函数.例如(从raster文档中复制):

r <- raster(ncols=36, nrows=18, xmn=0)
r[] <- runif(ncell(r))
# 3x3 mean filter
r3 <- focal(r, w=matrix(1/9,nrow=3,ncol=3))

文档包含更多详细信息.

Answer 3

你肯定想看一下这个EBImage包.有多种功能可以平滑图像.

例如,中值滤波器:

# Load EBImage up
require(EBImage)
# Read in your image
im = readImage('/path/to/your/image')
# Apply a median filter with window size of 7
im.med = medianFilter(im, size=7)
# Display image
display(im.med)

或者你可以尝试高斯模糊:

# Apply a gaussian blur with sigma=4
im.gaus = gblur(im, sigma=4)
# Display image
display(im.gaus)

希望这可以帮助!