Rstudio-server环境变量没有加载？

Question

我正在尝试在Cloudera的hadoop发行版上运行rhadoop(我不记得它的CDH3或4),并且遇到了一个问题:Rstudio服务器似乎无法识别我的全局变量.

在我的/etc/profile.d/r.sh文件中,我有:

export HADOOP_HOME=/usr/lib/hadoop
export HADOOP_CONF=/usr/hadoop/conf
export HADOOP_CMD=/usr/bin/hadoop
export HADOOP_STREAMING=/usr/lib/hadoop-mapreduce/

当我从终端运行R时,我得到:

> Sys.getenv("HADOOP_CMD")
[1] "usr/bin/hadoop"

但是当我运行Rstudio服务器时:

> Sys.getenv("HADOOP_CMD")
[1] ""

结果,当我尝试运行rhdfs时:

> library("rJava", lib.loc="/home/cloudera/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/2.15")
> library("rhdfs", lib.loc="/home/cloudera/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/2.15")
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rhdfs', details: 
    call: fun(libname, pkgname)
    error: Environment variable HADOOP_CMD must be set before loading package rhdfs
Error: package/namespace load failed for 'rhdfs'

有没有人知道我应该把我的环境变量放在那个特定的r.sh文件中？

谢谢!

Answer 1

您应该在.Renviron或中设置环境变量Renviron.site.我认为这些文件是在下面定义的R_HOME/etc/Renviron.site.您可以输入以下内容获取更多信息:

> ?Startup

有人在这里有类似的问题,这就是他为解决这个问题所做的.