cbo*_*tig 4 r lazy-evaluation jags r2jags jags.parallel
我有一个函数调用 (to jags.parallel),当给定数字参数时,该函数调用有效,n.iter = 100但当参数使用变量值 时,该函数调用失败n.iter = n.iter。这看起来可能是一个错误jags.parallel
错误的最小可重现示例:
library(R2jags)
model.file <- system.file(package="R2jags", "model", "schools.txt")
J <- 8.0
y <- c(28.4,7.9,-2.8,6.8,-0.6,0.6,18.0,12.2)
sd <- c(14.9,10.2,16.3,11.0,9.4,11.4,10.4,17.6)
jags.data <- list("y","sd","J")
jags.params <- c("mu","sigma","theta")
jags.inits <- function(){
list("mu"=rnorm(1),"sigma"=runif(1),"theta"=rnorm(J))
}
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
然后这有效:
jagsfit.p <- jags.parallel(data=jags.data, inits=jags.inits, jags.params,
n.iter=5000, model.file=model.file)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
但这并不:
n.iter=5000
jagsfit.p <- jags.parallel(data=jags.data, inits=jags.inits, jags.params,
n.iter=n.iter, model.file=model.file)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
给出错误:
Error in checkForRemoteErrors(lapply(cl, recvResult)) :
3 nodes produced errors; first error: object 'n.iter' not found
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
我认为这与不将变量导出到集群有关n.iter,但尚不清楚 jags.parallel 使用的是什么并行引擎。n.iter在将 R传递给函数之前, 有什么方法可以欺骗 R 进行计算吗?
do.call()在这种情况下是一个很好的朋友,因为(来自?do.call):
如果“quote”为“FALSE”(默认值),则对参数进行求值(在调用环境中,而不是在“envir”中)。
我确认以下工作有效,产生与jagsfit.p结果对象的打印方法显示的所有数字相匹配的结果:
jagsfit.p2 <- do.call(jags.parallel,
list(data=jags.data, inits=jags.inits, jags.params,
n.iter=n.iter, model.file=model.file))
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
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