通过rownames合并R中的2个以上数据帧

Question

我从4 df收集数据,并希望通过rownames合并它们.我正在寻找一种有效的方法来做到这一点.这是我拥有的数据的简化版本.

df1           <- data.frame(N= sample(seq(9, 27, 0.5), 40, replace= T),
                            P= sample(seq(0.3, 4, 0.1), 40, replace= T),
                            C= sample(seq(400, 500, 1), 40, replace= T))
df2           <- data.frame(origin= sample(c("A", "B", "C", "D", "E"), 40,
                                           replace= T),
                            foo1= sample(c(T, F), 40, replace= T),
                            X= sample(seq(145600, 148300, 100), 40, replace= T),
                            Y= sample(seq(349800, 398600, 100), 40, replace= T))
df3           <- matrix(sample(seq(0, 1, 0.01), 40), 40, 100)
df4           <- matrix(sample(seq(0, 1, 0.01), 40), 40, 100)
rownames(df1) <- paste("P", sprintf("%02d", c(1:40)), sep= "")
rownames(df2) <- rownames(df1)
rownames(df3) <- rownames(df1)
rownames(df4) <- rownames(df1)

这就是我通常会做的事情:

# merge df1 and df2
dat           <- merge(df1, df2, by= "row.names", all.x= F, all.y= F) #merge
rownames(dat) <- dat$Row.names #reset rownames
dat$Row.names <- NULL  #remove added rownames col

# merge dat and df3
dat           <- merge(dat, df3, by= "row.names", all.x= F, all.y= F) #merge
rownames(dat) <- dat$Row.names #reset rownames
dat$Row.names <- NULL  #remove added rownames col

# merge dat and df4
dat           <- merge(dat, df4, by= "row.names", all.x= F, all.y= F) #merge
rownames(dat) <- dat$Row.names #reset rownames
dat$Row.names <- NULL #remove added rownames col

如您所见,这需要大量代码.我的问题是,如果用更简单的方法可以实现相同的结果.我尝试过(没有成功):更新:现在可以了!

MyMerge       <- function(x, y){
  df            <- merge(x, y, by= "row.names", all.x= F, all.y= F)
  rownames(df)  <- df$Row.names
  df$Row.names  <- NULL
  return(df)
}
dat           <- Reduce(MyMerge, list(df1, df2, df3, df4))

在此先感谢您的任何建议

Answer 1

join_all从plyr可能会做你想要的.但它们都必须是数据框,并且rownames作为列添加

require(plyr)

df3 <- data.frame(df3)
df4 <- data.frame(df4)

df1$rn <- rownames(df1)
df2$rn <- rownames(df2)
df3$rn <- rownames(df3)
df4$rn <- rownames(df4)

df <- join_all(list(df1,df2,df3,df4), by = 'rn', type = 'full')

type 即使rownames变化也不匹配,参数应该有帮助如果你不想要rownames:

df$rn <- NULL

Answer 2

编辑你的函数,我想出了一个函数,它允许你通过特定的列键(列的名称)合并更多的数据帧.所得数据帧包括合并的数据帧的所有变量(如果你想只保留公共变量(不包括NA,用途:all.x= FALSE, all.y= FALSE)

MyMerge <- function(x, y){
  df <- merge(x, y, by= "name of the common column", all.x= TRUE, all.y= TRUE)
  return(df)
}
new.df <- Reduce(MyMerge, list(df1, df2, df3, df4))

Answer 3

我一直在寻找相同的功能.在这里和其他地方尝试了几个选项之后.对我来说最简单的是:

cbind.data.frame(df1,df2,df3,df4 ....)

Answer 4

三行代码将为您提供完全相同的结果：

dat2 <- cbind(df1, df2, df3, df4)
colnames(dat2)[-(1:7)] <- paste(paste('V', rep(1:100, 2),sep = ''),
                            rep(c('x', 'y'), each = 100), sep = c('.'))
all.equal(dat,dat2)    

啊，我明白了，现在我明白了，为什么你陷入如此痛苦的境地。使用旧for循环肯定可以解决问题。也许还有更聪明的解决方案

rn <- rownames(df1)
l <- list(df1, df2, df3, df4)
dat <- l[[1]]
for(i in 2:length(l)) {
  dat <- merge(dat, l[[i]],  by= "row.names", all.x= F, all.y= F) [,-1]
  rownames(dat) <- rn
}