use*_*439 5 python language-agnostic graph-theory adjacency-matrix graph-algorithm
基本上只是想知道这样做的好方法是在python中,我之前在python中使用了一种强力方式,但它只是不是直观的方式.所以,如果有人能帮忙,那就好了.
对于逐行网格,邻接矩阵如下所示:
row 1 row 2 row 3
----- ----- ----- _
A A A 1 . . . . . |
A A A . 1 . . . . | row 1
A A A . . 1 . . . _|
1 . . B B B 1 . . |
. 1 . B B B . 1 . | row 2
. . 1 B B B . . 1 _|
. . . 1 . . C C C |
. . . . 1 . C C C | row 3
. . . . . 1 C C C _|
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子矩阵在主对角线的每一侧都有两个对角线:
column
1 2 3 4 5 6
- - - - - -
. 1 . . . . 1 column
1 . 1 . . . 2
. 1 . 1 . . 3
. . 1 . 1 . 4
. . . 1 . 1 5
. . . . 1 . 6
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
def make_matrix(rows, cols):
n = rows*cols
M = matrix(n,n)
for r in xrange(rows):
for c in xrange(cols):
i = r*cols + c
# Two inner diagonals
if c > 0: M[i-1,i] = M[i,i-1] = 1
# Two outer diagonals
if r > 0: M[i-cols,i] = M[i,i-cols] = 1
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
对于3×4网格,矩阵看起来像:
. 1 . . 1 . . . . . . .
1 . 1 . . 1 . . . . . .
. 1 . 1 . . 1 . . . . .
. . 1 . . . . 1 . . . .
1 . . . . 1 . . 1 . . .
. 1 . . 1 . 1 . . 1 . .
. . 1 . . 1 . 1 . . 1 .
. . . 1 . . 1 . . . . 1
. . . . 1 . . . . 1 . .
. . . . . 1 . . 1 . 1 .
. . . . . . 1 . . 1 . 1
. . . . . . . 1 . . 1 .
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
一个很好的方法是使用Kronecker 乘积,它允许您快速构建一个类似于 Markus Jarderot 描述的矩阵。
这是具有周期性边界条件的晶格的代码
import scipy.linalg as la
import numpy as np
offdi = la.circulant([0,1,0,0,1])
I = np.eye(5)
import matplotlib.pyplot as plt
A = np.kron(offdi,I) + np.kron(I,offdi)
plt.matshow(A)
plt.show()
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此处np.kron(I,offdi)将矩阵offdi用于对网格一行内的连通性进行编码,位于主块对角线上。这是通过 Kronecker 乘以 来完成的I。 np.kron(offdi,I)做相反的事情:在下一个块对角线上和向下放置一个单位矩阵。这意味着一个节点向上和向下连接到连续行中同一列中的事物。
如果您希望网格是非周期性的,而只是具有没有链接的边界,则可以使用 Toeplitz 构造而不是循环构造: la.toeplitz([0,1,0,0,0])
我将首先为一些示例手动生成一些邻接矩阵,然后查看是否出现任何(易于编程的)模式。邻接矩阵取决于您如何标记节点(以什么顺序),因此不同的顺序可能会产生在生成函数中更容易或更难编码的模式。

这是一个有趣的问题,虽然我现在没有给你确切的答案,但我会继续思考(也许这可能有助于引导你或其他人找到解决方案)。