流程替代

Question

我已经看了一下让我困惑的事情,我只发现了这个问题: 有些程序不接受输入文件的进程替换吗？

这部分有帮助,但我真的很想了解全文.我注意到当我使用进程替换时,我的一些R脚本会给出不同的(即错误的)结果.

我试图用测试用例来查明问题:

这个脚本:

#!/usr/bin/Rscript

args  <- commandArgs(TRUE)
file  <-args[1]
cat(file)
cat("\n")
data <- read.table(file, header=F)
cat(mean(data$V1))
cat("\n")

使用以这种方式生成的输入文件:

$ for i in `seq 1 10`; do echo $i >> p; done
$ for i in `seq 1 500`; do cat p >> test; done

引导我到这个:

$ ./mean.R test
test
5.5

$ ./mean.R <(cat test)
/dev/fd/63
5.501476

进一步的测试显示有些线路丢失了...但我想了解原因.read.table(扫描给出相同的结果)是否使用seek？

PS.使用较小的测试文件(100)报告错误:

$./mean.R <(cat test3)
/dev/fd/63
Error in read.table(file, header = F) : no lines available in input
Execution halted

添加#1:使用已修改的脚本使用扫描结果是相同的.

Answer 1

我编写了这个通用函数,用于在我自己的脚本中打开文件连接:

OpenRead <- function(arg) {

   if (arg %in% c("-", "/dev/stdin")) {
      file("stdin", open = "r")
   } else if (grepl("^/dev/fd/", arg)) {
      fifo(arg, open = "r")
   } else {
      file(arg, open = "r")
   }
}

在您的代码中,替换file为file <- OpenRead(file),它应该处理以下所有内容:

./mean.R test
./mean.R <(cat test)
cat test | ./mean.R -
cat test | ./foo.R /dev/stdin