我正在计算由元组表示的两个向量之间的欧氏距离.
(u[0]-v[0])**2 + (u[1]-v[1])**2 + (u[3]-v[3])**2 ...
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这种硬编码方式非常快.但是,我不想对这些载体的长度做出任何假设.这导致了以下解决方案:
sum([(a-b)**2 for a, b in izip(u, v)]) # Faster without generator
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要么
sum = 0
for i in xrange(len(u)):
sum += (u[i]-v[i])**2
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结果比第一个版本慢很多(至少两次).是否有一些聪明的方法来优化这一点,而不是诉诸于NumPy/SciPy?我知道这些软件包提供了最快的方式来做这些事情,但目前,我更想尝试优化"裸Python"的经验.我发现快速工作的是动态构建一个定义函数及其的字符串exec(),但这确实是最后的手段,我想说......
要求:
exec()),纯Python尽管我的问题是关于一般小操作的问题,但您可以在解决方案中假设其中一个向量在多个函数调用中保持相同.
我的理解是,您并不真正需要使代码更快,您只是想知道为什么它更慢。为了回答这个问题,我们来看看反汇编。为了讨论的目的,我将把每个方法包装在一个函数调用中,在每个反汇编中可以忽略uand的加载v和返回命令。
def test1(u, v):
return (u[0]-v[0])**2 + (u[1]-v[1])**2 + (u[3]-v[3])**2
dis.dis(test1)
0 LOAD_FAST 0 (u)
3 LOAD_CONST 1 (0)
6 BINARY_SUBSCR
7 LOAD_FAST 1 (v)
10 LOAD_CONST 1 (0)
13 BINARY_SUBSCR
14 BINARY_SUBTRACT
15 LOAD_CONST 2 (2)
18 BINARY_POWER
19 LOAD_FAST 0 (u)
22 LOAD_CONST 3 (1)
25 BINARY_SUBSCR
26 LOAD_FAST 1 (v)
29 LOAD_CONST 3 (1)
32 BINARY_SUBSCR
33 BINARY_SUBTRACT
34 LOAD_CONST 2 (2)
37 BINARY_POWER
38 BINARY_ADD
39 LOAD_FAST 0 (u)
42 LOAD_CONST 4 (3)
45 BINARY_SUBSCR
46 LOAD_FAST 1 (v)
49 LOAD_CONST 4 (3)
52 BINARY_SUBSCR
53 BINARY_SUBTRACT
54 LOAD_CONST 2 (2)
57 BINARY_POWER
58 BINARY_ADD
59 RETURN_VALUE
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我将第一个示例剪掉了 3 的长度,因为它只会一遍又一遍地重复相同的模式。您可以很快看到没有函数调用开销,并且解释器几乎对这些操作数做了尽可能少的工作来实现您的结果。
def test2(u, v):
sum((a-b)**2 for a, b in izip(u, v))
dis.dis(test2)
0 LOAD_GLOBAL 0 (sum)
3 LOAD_CONST 1 (<code object <genexpr> at 02C6F458, file "<pyshell#10>", line 2>)
6 MAKE_FUNCTION 0
9 LOAD_GLOBAL 1 (izip)
12 LOAD_FAST 0 (u)
15 LOAD_FAST 1 (v)
18 CALL_FUNCTION 2
21 GET_ITER
22 CALL_FUNCTION 1
25 CALL_FUNCTION 1
28 RETURN_VALUE
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我们在这里看到的是,我们从生成器表达式中创建了一个函数,加载 2 个全局变量(sum 和 izip,全局查找比本地查找慢,我们无法避免创建一次它们,但是如果它们要在一个紧密的循环,很多人将它们分配给本地,例如_izip或_sum),然后连续遭受 4 个昂贵的字节码操作,调用 izip,从生成器获取迭代器,调用生成器创建的函数,然后调用sum 函数(它将消耗迭代器并在返回之前添加每个项目)。
def test3(u, v):
sum = 0
for i in xrange(len(u)):
sum += (u[i]-v[i])**2
dis.dis(test3)
0 LOAD_CONST 1 (0)
3 STORE_FAST 2 (sum)
6 SETUP_LOOP 52 (to 61)
9 LOAD_GLOBAL 0 (xrange)
12 LOAD_GLOBAL 1 (len)
15 LOAD_FAST 0 (u)
18 CALL_FUNCTION 1
21 CALL_FUNCTION 1
24 GET_ITER
25 FOR_ITER 32 (to 60)
28 STORE_FAST 3 (i)
31 LOAD_FAST 2 (sum)
34 LOAD_FAST 0 (u)
37 LOAD_FAST 3 (i)
40 BINARY_SUBSCR
41 LOAD_FAST 1 (v)
44 LOAD_FAST 3 (i)
47 BINARY_SUBSCR
48 BINARY_SUBTRACT
49 LOAD_CONST 2 (2)
52 BINARY_POWER
53 INPLACE_ADD
54 STORE_FAST 2 (sum)
57 JUMP_ABSOLUTE 25
60 POP_BLOCK
61 LOAD_CONST 0 (None)
64 RETURN_VALUE
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我们在这里看到的是 中发生的事情的更简单的版本test2。没有生成器表达式或对 sum 的调用,但我们用不必要的函数调用替换了函数调用开销,而xrange(len(u))不是 @Lucas Malor 建议的更快的解决方案。
def test4(u, v):
mysum = 0
for a, b in izip(u, v) :
mysum += (a-b)**2
return mysum
dis.dis(test4)
0 LOAD_CONST 1 (0)
3 STORE_FAST 2 (mysum)
6 SETUP_LOOP 47 (to 56)
9 LOAD_GLOBAL 0 (izip)
12 LOAD_FAST 0 (u)
15 LOAD_FAST 1 (v)
18 CALL_FUNCTION 2
21 GET_ITER
22 FOR_ITER 30 (to 55)
25 UNPACK_SEQUENCE 2
28 STORE_FAST 3 (a)
31 STORE_FAST 4 (b)
34 LOAD_FAST 2 (mysum)
37 LOAD_FAST 3 (a)
40 LOAD_FAST 4 (b)
43 BINARY_SUBTRACT
44 LOAD_CONST 2 (2)
47 BINARY_POWER
48 INPLACE_ADD
49 STORE_FAST 2 (mysum)
52 JUMP_ABSOLUTE 22
55 POP_BLOCK
56 LOAD_FAST 2 (mysum)
59 RETURN_VALUE
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以上代表了 @Lucas Malor 的贡献,并且在某些方面速度更快。它用解包代替了下标操作,同时将调用次数减少到 1。在许多情况下,这与您给我们的约束所能达到的速度一样快。
请注意,只有当您要调用该函数足够多次以值得开销时,才值得eval使用与 test1 中的函数类似的运行时生成的字符串。另请注意,随着 u 和 v 的长度变得越来越大(这通常是评估此类算法的方式),其他解决方案的函数调用开销变得越来越小,因此,在大多数情况下,可读性最强的解决方案要优越得多。同时,即使在小情况下速度较慢,但如果序列 u 和 v 的长度可能非常长,我建议使用生成器表达式而不是列表理解。在大多数情况下,内存节省将导致执行速度更快(以及更快的GC)。
总的来说,我的建议是,在短序列的情况下,微小的加速并不值得增加代码大小,并且与您正在通过执行微优化查看的其他 Python 实现不一致的行为。“最佳”解决方案几乎肯定是test2。