"不对称"成对距离矩阵

POT*_*NZA 6 r matrix symmetry traminer

假设有三个序列要比较:a,b和c.传统上,得到的3乘3成对距离矩阵是对称的,表明从a到b的距离等于从b到a的距离.

我想知道TraMineR是否提供了一些方法来产生不对称的成对距离矩阵.

Gil*_*ert 6

不,TraMineR不会因Pat的评论中强调的原因而产生"不对称"差异.

计算序列之间成对差异的主要好处是,一旦我们有这样的不同,我们就可以

  • 测量序列之间的差异,确定邻域,找到中间体,......
  • 运行集群算法,自组织映射,MDS,...
  • 对序列进行类似ANOVA的分析
  • 为序列生成回归树

在这些过程中输入非对称相异矩阵最有可能产生不相关的结果.

正是由于这种对称性要求,用于计算最佳匹配距离的替代成本必须是对称的.重要的是不要将替代成本解释为从一种状态转换到另一种状态的成本,而是将它们理解为它们是什么,即编辑成本.当比较两个序列,例如 aabccaadcc,我们就可以使它们或者通过任意地取代等于bd在所述第一一个或db在第二个.然后,如果不给两个替换的成本相同则没有意义.

希望这可以帮助.