bash通过匹配列来合并文件

Question

我有两个文件:

 File1

 12    abc
 34    cde
 42    dfg
 11    df
 9     e   


 File2

 23    abc
 24    gjr
 12    dfg
 8     df

我希望逐列合并文件(如果第2列相同),输出如下:

  File1  File2
   12    23    abc
   42    12    dfg
   11    8     df
   34    NA    cde
   9     NA    e
   NA    24    gjr

我怎样才能做到这一点？

我试过这样的:

 cat File* >> tmp; sort tmp | uniq -c | awk '{print $2}' > column2; for i in
 $(cat column2); do grep -w "$i" File*

但这就是我被卡住的地方......
不知道如何在greping之后我应该逐列组合文件并写入缺少值的NA.

希望有人可以帮助我.

Answer 1

由于我使用bash3.2运行as sh(它没有进程替换sh),我使用了两个临时文件来准备好使用的数据join:

$ sort -k2b File2 > f2.sort
$ sort -k2b File1 > f1.sort
$ cat f1.sort
12    abc
34    cde
11    df
42    dfg
9     e  
$ cat f2.sort
23    abc
8     df
12    dfg
24    gjr
$ join -1 2 -2 2 -o 1.1,2.1,0 -a 1 -a 2 -e NA f1.sort f2.sort
12 23 abc
34 NA cde
11 8 df
42 12 dfg
9 NA e
NA 24 gjr
$

通过进程替换,您可以编写:

join -1 2 -2 2 -o 1.1,2.1,0 -a 1 -a 2 -e NA <(sort -k2b File1) <(sort -k2b File2)

如果您希望数据格式不同,请使用awk后处理输出:

$ join -1 2 -2 2 -o 1.1,2.1,0 -a 1 -a 2 -e NA f1.sort f2.sort |
> awk '{ printf "%-5s %-5s %s\n", $1, $2, $3 }'
12    23    abc
34    NA    cde
11    8     df
42    12    dfg
9     NA    e
NA    24    gjr
$