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安装后有没有办法删除端口的构建依赖项？

许多端口使用外来工具进行构建，并且在构建和安装端口时不再使用这些工具。

我有一个可能是 rootkit 的系统（安装了 IRC bot 并且在 /usr/bin、/usr/sbin、/bin、/sbin 上设置了 +ai 属性）。IRC bot 被删除，系统从 4.0 升级到 5.0.4。恐怕我提到的文件夹中的某些内容已被修改。我无法重新安装盒子，那么有什么方法可以检查系统的完整性吗？我已经检查了 rkhunter 和 chrootkit。