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MyISAM 用于将每个表存储在相应的文件中很方便。InnoDB 在很多方面都取得了进步，但我想知道为什么 InnoDB 将所有数据库存储在一个文件中（ibdata1默认情况下）。

我知道 InnoDB 将通过表的单个索引文件映射文件中数据的位置，但我不明白为什么它将所有数据混合在一个文件中。更重要的是，为什么要混合服务器上所有数据库的数据？

MyISAM 的一个有趣功能是，可以将数据库文件夹复制/粘贴到另一台机器上，然后使用该数据库（无需转储）。

我们有一个应用程序，其中只有一个表将增长到数百万行，而其余的将略低于一百万行。那么我们应该使用 innodb_file_per_table 还是保留一个 .ibd 的建议是什么？我读过一些文章说不要使用它，因为在执行连接时您需要更多磁盘访问权限？为了报告生成目的，我们将在此表和其他表之间进行连接。

服务器规格：具有以下信息的 VPS

model name  : Intel(R) Xeon(R) CPU           E5649  @ 2.53GHz
MemTotal:      2058776 kB
MemFree:        244436 kB

我们正在运行来自 Invision Power Services 的 IP.Board，我们正在使用 innodb_file_per_table并重新加载数据库以减少 ibdata1 大小。但是，尽管减小了ibdata1尺寸，但我们最近仍然遇到了 CPU 和 I/O 使用率高的问题。

根据我的检查，我认为它是由ibdata1. 下面是我使用pt-ioprofile -cell sizes（在 Percona ToolKit 中）获得的数据。基本上，它是在 30 秒内收集的总 I/O 量。

# pt-ioprofile -cell sizes
Fri Jul 20 10:22:23 ICT 2012
Tracing process ID 8581
     total      pread       read     pwrite      fsync       open      close   getdents      lseek      fcntl filename
   6995968          0          0    6995968          0          0          0 …

在 MySQL InnoDB 数据库中安排表的自动优化的最佳方法是什么？例如，我可以使用事件吗？我最近遇到了一个很大的性能问题（在查询时），其中一个表实际上是我数据库中最大的表，并且经常更新。我在表上运行OPTIMIZE后，问题就解决了。