以下是一些蛋白质相互作用数据库：
http://dip.doe-mbi.ucla.edu/dip/Main.cgi
作为新手，在使用大约 20,000 个蛋白质的数据集尝试任何此类项目之前，我必须了解数据库的哪些实际方面？作为管理员，我在设计和实施这样一个项目的过程中会遇到什么困难？
我早些时候开始写一个关于数据库设计和实现的某些方面的答案，我放弃了，因为我意识到这些不会（或不应该）是开发数据库（或更广泛地说，软件）的第一步满足您的需求。这样，这可能不是您正在等待的答案。
几年前，作为一个新手，我也很想制作一些大而有趣的东西。（老实说，我只有那个特定项目所需能力的一部分。我希望一旦我准备好数据库部分（我知道如何做），每个人都会非常相信它会很棒，他们会对我犯错和（非常）缓慢有必要的耐心。）当我开始做我的事情时，我意识到
现在，在这个出来之后，回到你的项目:)
要决定是否必须开发新东西，您必须考虑一些事情。
您的数据是否如此特殊以至于只有新软件才适合？ 可能有（开源）软件，您可以在稍作修改后使用。通过这种方式，您可能可以获得更多帮助（最好来自编写该软件的人）并更快地完成。而且，最后，如果您添加的内容有效且有用，您就可以发布它。它肯定会为您赢得声誉。（更不用说你的引文索引会更好：）
你真的很需要它吗？ 由于开发将花费大量时间（可能还需要金钱），因此您必须评估成本和收益。在成本方面，不会有单独的数据库：您必须能够使用您的数据库（为它提供数据并从中获得结果）。即使保持简单，它仍然可以使所需的努力加倍。总的来说，如果收益没有明显大于成本，我不会从它开始。
您是否具备实现目标所需的专业知识？ 希望是的，但如果不是，那么您的系统将效率低下、有缺陷或完全无用。随着工作的进展，您当然会获得经验，但是调试和重写编写得不好的代码可能比再次编写代码要困难得多。
（我可能在这里太小心了，但我讨厌写了一半的软件。而且，如果你的主要目标是获得经验，并且你有必要的资源（包括走遍所有死胡同的奢侈），那么开始而且，如果你的答案是三个是，那么你仍然应该阅读一本关于数据库设计和开发的好书——它的领域比简短的答案所能涵盖的范围要广泛得多。）