为目录中的每个 .fastq 文件生成单独的 .md5 文件？

Question

我正在尝试为目录中的每个 .fastq 文件生成单独的 .md5 文件。我找到了为多个文件生成单个 .md5 文件的解决方案，但这不是我想要的。

我有file1.fastq, file2.fastq,file3.fastq并且想要生成file1.md5, file2.md5, file3.md5。

我认为 FOR 循环可以解决问题，但我不是程序员，似乎无法找到解决此问题的方法。

我还尝试了以下代码：

find . -type f -name "*.fastq.gz" -exec sh -c "md5sum < {} > {}.md5" \;

它为每个 .fastq 文件正确生成一个 .md5 文件，但 .md5 文件内容不正确，即我得到 64399513b7d734ca90181b27a62134dc -

代替 64399513b7d734ca90181b27a62134dc testfile.fastq

任何人都可以帮忙吗？

Answer 1

最简单的情况是：

for file in *fastq; do md5sum "$file" > "$file".md5; done

但是，这将创建文件名，如file1.fastq.md5. 扩展在这里基本上是无关紧要的，所以这不是问题，但如果你更喜欢file1.md5这样做：

for file in *fastq; do md5sum "$file" > "${file//.fastq}".md5; done